Využití molekulárních markerů ve šlechtitelských programech řepky

Bc. Helena KRISTINOVÁ

Diplomová práce

Utilization of molecular markers in oil seed rape breeding programmes

Anotace:

Ve snaze zvýšit produkci je šlechtění zaměřeno na linie využitelné pro tvorbu F1 hybridů. Samčí sterilita a autoinkompatibilita by zde pak mohla najít významné uplatnění. Velké naděje jsou v posledních letech vkládány do tzv. molekulárních metod, tedy postupů, které v našem případě využívají molekulárně-genetických technik, které jsou rychlejší, spolehlivější a hlavně specifičtější než klasické postupy založené na morfologických deskriptorech. Cílem diplomové práce byla optimalizace metod PCR analýzy a vývoj markerů pro selekci cílových rostlin v programech hybridního šlechtění řepky. V diplomové práci byl testován nový marker detekující gen obnovy fertility (Rf) u rostlinného materiálu CMS Ogu-INRA. Primerový pár RsPPRF2/RsPPRR2 byl vytvořen v kódující oblasti pro PPR-B protein, který se podílí na obnově fertility u CMS Ogu-INRA. Navržené primery BrSLGIIF/BrSLGIIR se testovaly u AI rostlin. Nejoptimálnější teplota nasedání testovaných primerů BrSLGIIF/BrSLGIIR byla z testovaného rozmezí 58 °C. Přesto docházelo k amplifikaci i u AK rostlin. U nově navržených primerů byla provedena optimalizace podmínek PCR reakce. S použitím dostupných primerů e/f byl technikou PCR-RFLP testován soubor F1 hybridů vzniklých po křížení AI linií s odlišnými S II haplotypy, za účelem detekce možného polymorfimu.

Abstract:

Current breeding of oilseed rape is focused on breeding of F1 hybrids and the male sterility and self-incompatibility could play the significant role in hybrid breeding programmes. Plant breeders also more widely utilize molecular genetic techniques for selection of desirable plants/genotypes. Molecular methods are faster, more reliable and more specific than conventional ones, which are based mainly on morphological descriptors. The aim of my thesis was to optimize PCR analysis methods and to develop specific molecular markers for target plant selection in oilseed rape hybrid breeding programmes. The new marker for detection of fertility restoration gene (Rf) in CMS Ogu-INRA plants was tested. New primer pair RsPPRF2/RsPPRR2 was designed in the coding region of PPR-B protein, which participates in the restoration of fertility in CMS Ogu-INRA. Also newly designed primers BrSLGIIF/BrSLGIIR were tested in SI plants. The optimal annealing temperaturse of these primers was 58 °C. But amplification in some SC plants was also observed. The optimization of the PCR reaction was performed for all designed primers. The set of F1 SI hybrids created by crossing of two lines with different S II haplotypes was tested by using of the PCR-RFLP technique for detection of polymorphism in amplified fragments.

Klíčová slova

Brassica napus, molekulární markery, PCR, CMS, AI

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 4. 2013

Zveřejnit od: 26. 4. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Lenka Havlíčková, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Zemědělská fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Zemědělské inženýrství / Rostlinné biotechnologie