Identifikace interaktomu lidských uridylyltransferáz v buňce

Bc. Markéta Nečasová

Bachelor's thesis

Identification of the in cellulo interactions of human uridylyltransferases

Anotácia:

Posttranskripční modifikace RNA jsou důležitou součástí metabolických drah či dozrávání RNA. Jednou z těchto modifikací je uridylace 3´konce prováděná terminálními uridylyltransférazami (TUT) z proteinové nadrodiny TENT. U lidí byli identifikováni tři zástupci TUTáz – TUT1, TUT4 a TUT7. U zástupců TUT4 a TUT7 byla potvrzena kooperace s proteinovými partnery, kteří tím získávají schopnost regulace enzymatické aktivity těchto TUTáz. Doposud byli popsáni pouze dva interakční partneři Lin28A a MOV10. Cílem práce byla příprava expresních konstruktů pro TUT4 a TUT7 a jejich testy, které budou následně sloužit pro studium interakcí v buňce.

Abstract:

Post-trancriptional modifications of RNA are part of metabolic pathways and maturation of RNA. One of these modifications is uridylation of 3´end of RNA performed by terminal uridylyltransferases (TUTs) from TENT protein superfamily. There are three representatives of TUTases identified in human – TUT1, TUT4 and TUT7. TUT4 and TUT7 has been confirmed to cooperate with protein partners, who thus gain the ability of regulation enzymatic activity of these TUTases. Until today there are described only two interaction partners Lin28A and MOV10. The aim of this work was preparation of expression constructs for TUT4 and TUT7 and their testing, so they can be used for farther studies of interactions in cell.

Kľúčové slová

TENT, TUT, post-transcriptional modifications, TUT4, TUT7, uridylation, protein interactions

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2022
• Vedúci: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
• Oponent: Ing. Pavla Musilová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry