Analýza CRISPR-Cas systémů a jejich aplikační využití v editaci genomů u Staphylococcaceae – Bc. Jiří Holoubek
Bc. Jiří Holoubek
Master's thesis
Analýza CRISPR-Cas systémů a jejich aplikační využití v editaci genomů u Staphylococcaceae
Analysis of CRISPR-Cas systems and their application in genome editing of Staphylococcaceae
Abstract:
CRISPR/Cas systémy adaptivní imunity, které chrání bakterie před vniknutím cizorodé DNA, nebyly doposud u rodu Staphylococcus komplexně prozkoumány. V této práci bylo v genomech stafylokoků detekováno 220 CRISPR/Cas systémů. Byla provedena analýza CRISPR lokusů i fylogenetická analýza cas genů, která potvrdila, že nejkonzervovanější geny jsou cas1, cas2 a cas10. Systém CRISPR/Cas10 byl využit pro úpravu …moreAbstract:
CRISPR/Cas adaptive immunity systems, which protect bacteria from the foreign DNA, have not been comprehensively investigated in the genus Staphylococcus. In this work, 220 CRISPR/Cas systems were detected in their genomes. Analysis of CRISPR loci as well as phylogenetic analysis of cas genes were performed, which confirmed that the most conserved genes are cas1, cas2 and cas10. The CRISPR/Cas10 system …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 6. 2020
Identifier:
https://is.muni.cz/th/ykjut/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 7. 2020
- Supervisor: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
- Reader: Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
HOLOUBEK, Jiří. \textit{Analýza CRISPR-Cas systémů a jejich aplikační využití v editaci genomů u Staphylococcaceae}. Online. Master's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2020. Available from: https://theses.cz/id/oajjkx/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Experimental Biology / Special Biology
Theses on a related topic
-
Genetic engineering of psbA gene in Nicotiana tabacum
Dagmar HUCKOVÁ -
Genové úpravy sinic pro degradaci plastů
Alžběta Kubíková -
Metody pro cílené editace genomu
Karolína Majkusová -
Evoluce CRISPR-Cas systémů a jejich využití v editaci bakteriálních genomů
Jiří Holoubek -
Modifikace bakteriálních a fágových genomů pomocí CRISPR-Cas10 systému
Anna Sobotková -
Strukturní a funkční analýza CRISPR/Cas lokusu v genomu koaguláza-negativních stafylokoků
Kristýna Kořená