Vliv toxinů na metabolické dráhy v modelových systémech

Mgr. Eva Šafaříková

Bachelor's thesis

Toxin influence on metabolic pathways in model systems

Anotácia:

V této bakalářské práci se věnuji kyselině retinové a jejímu vlivu na buněčné linie, zejména lidské buňky MCF-7 a modelový organismus Danio rerio. Dále se zaměřuji na Wnt/β-kateninovou dráhu a změny genové exprese genů NDRG1 a ATF3. Poslední výzkumy ukazují, že retinoidní látky, včetně kyseliny all-trans retinové, jsou přirozenou součástí sinic a řas v prostředí, a proto je nutné jejich výskyt a působení dále zkoumat. Z tohoto důvodu byl v rámci bakalářské práce studován také vliv extraktů sinice Aphanizomenon gracile a řasy Scenedesmus quadricauda na buňky MCF-7. Experimentální část je zaměřena na použití metody kvantitativní real-time PCR s použitím SYBR Green I pro pozorování změn genové exprese v buňkách. Změna exprese byla sledována na genu NDRG1.

Abstract:

In this thesis I follow retinoic acid and its effect on cell lines, especially human breast cells MCF-7 and model organism Danio rerio. Next, I focus on the Wnt/β-catenin pathway and changes of gene expression of genes NDRG1 and ATF3. Recent studies indicate that retinoids, including all-trans retinoic acid, are natural part of cyanobacteria and algae in the environment. Therefore, it is necessary to continue to study their occurrence and impact. For this reason, the effect of extract of cyanobacteria Aphanizomenon gracile and algae Scenedesmus quadricauda on cells MCF-7 was also studied in this thesis. The experimental part focuses on the use of quantitative real-time PCR using SYBR Green I for observing changes of gene expression in cells. The changes of expression were observed on the gene NDRG1.

Kľúčové slová

qPCR, kvantitativní real-time PCR, kyselina retinová, kyselina all-trans retinová, ATRA, sinice, cyanobakterie, MCF-7, rakovina prsu, NDRG1, Wnt/β-kateninová dráha, Aphanizomenon gracile, Scenedesmus quadricauda, quantitative real-time PCR, retinoic acid, all-trans retinoic acid, cyanobacterium, breast cancer, Wnt/β-catenin pathway

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2014
• Vedúci: Mgr. Andrea Vítečková Wünschová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology