Cílená lipidomická analýza plasem myší s deficitem glutamátkarboxypeptidasy II

Bc. Kateřina HANÁKOVÁ

Bakalářská práce

Targeted lipidomic analysis of mice plasma with the glutamate carboxypeptidase II deficiency

Anotace:

Glutamátkarboxypeptidasa II (GCPII, EC 3.4.17.21), transmembránový glykoprotein II. typu, jehož polypeptidový řetězec se skládá ze 750 aminokyselin patří do enzymové rodiny M28 metalopeptidas. K její expresi u člověka dochází zejména v mozku, prostatě a tenkém střevě. V mozku GCPII hydrolyzuje neurotransmiter N-acetyl-L-aspartyl-L-glutamát na N-acetyl-L-aspartát a volný glutamát, jehož kumulace působí neurotoxicky. V tomto ohledu je inhibice GCPII považována za neuroprotektivní. V tenkém střevě hraje GCPII zásadní roli při metabolismu folátů, v prostatě je její biologická aktivita zatím neznámá, nicméně slouží jako marker rakoviny prostaty. V praktické části byly vzorky plasem myší podrobeny cílené lipidomické analýze za využití kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Cílem práce bylo hledat změny v lipidovém profilu myší s delecí v genu pro GCPII oproti zdravým kontrolám. Změny v lipidovém profilu byly však pozorovány zejména v souvislosti s věkem a pohlavím. Inaktivace GCPII nemá dle našich výsledků výrazný vliv na lipidový profil plasmy.

Abstract:

Glutamate carboxypeptidase II (GCPII, EC 3.4.17.21) is a type of II transmembrane glycoprotein consisted of 750 amino acids residues. GCPII belongs to the family M28 of metallopeptidases. The enzym is mainly expressed in human brain, prostate and small intestine. GCPII in human brain hydrolyses the neurotransmitter N-acetyl-L-aspartyl-L-glutamate to N-acetyl-L-aspartate and free glutamate which cumulation is neurotoxic. Here, the inhibition of GCPII is considered to be neuroprotective. GCPII in small intestine has a crucial role in folate metabolism, however, there isn't known biological activity of GCPII in prostate. It serves as a marker of prostate cancer. In the experimental part, the mice plasma samples were put through targeted lipidomic analysis using the liquid chromatography in connection with tandem mass spectrometry. The aim of this study was looking for the changes in the lipid profile of mice with deletion of GCPII gene in contrast to the healthy controles. According to the results, inactivation of GCPII has no substantial effect on the lipid profile. The changes in lipid profile were only found between different gender and age.

Klíčová slova

Glutamátkarboxypeptidasa II, lipidy, lipidomika, hmotnostní spektrometrie

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2019
• Vedoucí: Mgr. Radana Brumarová

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie