Molekulární charakterizace rezistence a virulence epidemických klonů Klebsiella pneumoniae pomocí sekvenování nové generace

Bc. Martina Strnadová

Master's thesis

Resistome and virulome molecular characterisation of Klebsiella pneumoniae epidemic clones using next generation sequencing

Anotácia:

V uplynulém desetiletí se druh Klebsiella pneumoniae stal jednou z hlavních hrozeb pro zdraví převážně imunokomprimitovaných pacientů, kvůli prevalenci infekcí způ-sobených kmeny, které jsou rezistentní na jeden i více antimikrobiálních přípravků. Produkce širokospektrých β-laktamáz nebo karbapenemáz však není jediným problémem. V současné době dochází k rychlému šíření hypervirulentních kmenů, které jsou schopné exprimovat získané faktory virulence. Pro zabránění vzniku epidemií a šíření epidemických klonů je důležité tuto bakterii analyzovat na molekulární úrovni. Cílem diplomové práce je charakterizace epidemických klonů vyskytujících se ve FN Brno a detekce jejich faktorů virulence a rezistence.

Abstract:

Over the past decade, Klebsiella pneumoniae has been one of the major threats to the health of predominantly immunocompromised patients, due to the prevalence of infections caused by strains that are resistant to one or more antibiotics. However, the production of broad-spectrum β-lactamases or carbapenemases is not the only problem. Currently, decide on the rapid spread of hypervirulent strains that are affected to express virulence factors. To protect epidemics and the spread of epidemic clones, it is important to analyze this bacterium at the molecular level. The aim of the diploma thesis is to characterize epidemic clones occurring in the Brno University Hospital and to detect their virulence and resistance factors.

Kľúčové slová

Rezistence, Virulence, Klebsiella pneumoniae, Minim typing, Sekvenování nové generace, Epidemické klony, Antibiotic resistance, Next-Generation Sequencing, Epidemic clones

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 6. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 7. 2021
• Vedúci: doc. Mgr. Martina Lengerová, Ph.D.
• Oponent: MUDr. Ivana Vítková

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Microbiology / Microbiology