Velikost genomu vrb z podrodu Salix subgen. Salix se zaměřením na smuteční vrby (Salix babylonica agg.)

Bc. Veronika CHODILOVÁ

Master's thesis

Genome-size variability in willows (Salix subgen. Salix) with special emphasis on weeping willows (Salix babylonica agg.)

Abstract:

Metoda průtokové cytometrie byla využita pro stanovení absolutní a relativní velikosti genomu a stanovení DNA-ploidní úrovně u taxonů rodu Salix podrod Salix se zaměřením na skupinu smutečních vrb. Z celkových 97 analyzovaných vzorků byla nejmenší hodnota absolutní velikosti genomu naměřena u diploidního poddruhu S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Naopak největší absolutní velikost genomu byla zjištěna u hexaploidního druhu S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). Po porovnání nejmenší hodnoty obsahu jaderné DNA a největší hodnoty obsahu jaderné DNA bylo zjištěno, že se od sebe hodnoty liší 4násobně. DNA-ploidní úrovně u podrodu Salix byly zjištěny od diploidní po hexaploidní úroveň s tím, že tetraploidní úroveň byla převládající. Získané výsledky mohou doplnit databázi mapování genomů, která slouží pro vzájemné porovnání rostlinných genomů při zjišťování absolutní velikosti genomu u krytosemenných rostlin. U některých případů se jedná o vůbec první informace ohledně velikosti genomu u určitých druhů, kříženců nebo kultivarů.

Abstract:

The method of flow cytometry has been used to determine absolute and relative size of genome size and also to determine DNA-ploidy level for taxons of genus Salix subgen. Salix with special emphasis on weeping willow trees. From all the 97 analysed samples the lowest absolute genome size value has been measured / detected at diploid subsp. S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Contrarily the highest absolute genome size value has been detected at hexaploid species S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). After comparing the values of the smallest nuclear DNA content and of the biggest nuclear DNA discovery has been made with the finding that the values differ 4 times. DNA-ploidy level at Salix subgen. Salix were detected from diploid to hexaploid level with the conclusion that the tetraploid level was the predominant one. The results which has been obtained might supplement the database for genome mapping, that serves for reciprocal comparison of vegetal genomes when investigating the absolute size of the genom with angiosperm plants. At some case this is the very first information concerning the genom size of some specific varieties, hybrids or cultivars.

Keywords

hybridizace, polyploidie, průtoková cytometrie, Salicaceae, velikost genomu

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2022

Thesis defence

• Supervisor: doc. RNDr. Radim Jan Vašut, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Ecology and Environmental Protection / Ecology and Environmental Protection