Charakterizace kandidátních genů jetele (Trifolium) pro izoflavonoidy a studium jejich variability

Bc. Marie Štefková

Master's thesis

Characterization of candidate genes for isoflavonoids and study of their variability in clovers (Trifolium)

Anotácia:

Izoflavonoidy jsou skupinou sekundárních metabolitů, které se přirozeně vyskytují téměř výhradně u rostlin z čeledi Fabaceae. Tyto látky zastávají důležité funkce v rostlinách a díky svým chemickým vlastnostem mají také širokou škálu účinků na živočišné organismy. Jetel luční (Trifolium pratense L.) a jetel prostřední (T. medium L.) jsou významným zdrojem těchto látek. Studium jejich biosyntézy u těchto druhů může pomoci při šlechtění nových odrůd s vysokým či nízkým obsahem izoflavonoidů. Hlavním cílem této diplomové práce byla charakterizace genů kódujících enzymy biosyntézy izoflavonoidů in silico ze sekvenačních dat T. pratense a T. medium. Dále byla provedena expresní analýza vybraných genů kódujících enzymy chalkon syntázu a chalkon reduktázu metodou qRT-PCR, což by mohlo odhalit souvislost mezi obsahem izoflavonoidů u T. pratense a T. medium a hladinou exprese těchto genů.

Abstract:

Isoflavonoids are a group of secondary metabolites, which occur almost exclusively in plants of the Fabaceae family. These compounds fulfill important roles in plants and thanks to their chemical properties they have a wide range of effects on animal organisms. Red clover (Trifolium pratense L.) and zigzag clover (T. medium) are a significant source of these compounds. Study of their biosynthesis in these species can help with breeding of new varieties with high or low content of isoflavonoids. The main aim of this diploma thesis was in silico characterization of genes encoding enzymes of the isoflavonoid biosynthetic pathway from the sequencing data of T. pratense and T. medium. Further, an expression analysis of selected genes encoding enzymes chalcone synthase and chalcone reductase using the qRT PCR method was performed, which could reveal a relationship between the isoflavonoid content in T. pratense and T. medium and the expression level of these genes.

Kľúčové slová

izoflavonoidy, biosyntéza, Trifolium, expresní analýza, qRT-PCR, isoflavonoids, biosynthesis, expression analysis

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 6. 2016
• Vedúci: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics