Identifikace a funkční charakterizace exozomálních dlouhých nekódujících RNA u pacientů s kolorektálním karcinomem.

Mgr. Renata Bartošová

Master's thesis

Identification and functional characterization of long non-coding RNAs enriched in colorectal cancer cell-derived exosomes.

Abstract:

Kolorektální karcinom představuje jedno z nejčastěji diagnostikovaných nádorových onemocnění a zároveň zaujímá přední příčky i v případě úmrtí nimi způsobenými. Jeho včasná diagnostika poskytuje výrazně lepší vyhlídky pro dlouhodobé přežití pacientů, a proto na poli výzkumu probíhá intenzivní snaha o identifikaci nových biomarkerů schopných detekovat již časná stádia tohoto onemocnění. Moderní přístupy k diagnostice také stále více inklinují k použití více neinvazivních metod. Z tohoto důvodu jsou jako významné potenciální markery označovány i molekuly obsažené v malých extracelulárních vezikulech (mRNA, nekódující RNA, proteiny). Tyto vezikuly slouží k buněčné komunikaci na velké vzdálenosti a nádorové buňky je zneužívají pro ovlivnění mikroprostředí a podporu jejich růstu či metastázování do vzdálených tkání. U malých extracelulárních vezikul odvozených od nádorových buněk mohou být detekovány specifické hladiny jednotlivých obsažených molekul, jejichž detekce by mohla významným způsobem zpřesnit diagnózu. Tyto vezikuly jsou vylučovány do všech tělních tekutin a jejich izolace patří mezi málo invazivní procesy. V rámci této práce byly studovány molekuly dlouhých nekódujících RNA patřících do skupiny významných regulátorů genové exprese, které jsou přenášené malými extracelulárními vezikuly.

Abstract:

Colorectal cancer counts as one of the most frequent cancers worldwide and simultaneously causes the substantial number of cancer-related deaths. Its early diagnosis provides significantly better prospects for patients suffering from this disease. For this reason, identification of novel biomarkers capable of early detection of the disease is es-sential. Moreover, modern diagnostics approaches demand more innovative and less invasive methodology to be developed. For this reason, small extracellular vesicles associated molecules (mRNA, non-coding RNA, proteins) are at the peak of scientific interest as they are means of the cell long-distance communication. Cancer cells utilize them to influence microenvironment and to support their growth or dissemination in distant organs. Their secretion into body fluids enables their rapid isolation and analysis. Significant improvements in diagnostics accuracy could be therefore achieved by the analysis of these cancer cell expressed molecules, that also reflects the state of the cell of origin. In this thesis, long non-coding RNAs, potent regulators of gene expression, were studied.

Keywords

Kolorektální karcinom, dlouhé nekódující RNA, malé extracelulární vezikuly, diagnostické markery, qPCR

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 28. 6. 2023
• Supervisor: Mgr. Petra Vychytilová, Ph.D.
• Reader: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Animal Biology and Immunology / Immunology