Mapování genetické variability parvoviru masožravců u vakcinovaných a nevakcinovaných psů a koček

Bc. Christina VLAŠÍNOVÁ

Diplomová práce

Anotace:

Parvoviróza je závažné onemocnění trávicího traktu, které je v populaci psů i koček stále aktuální. Přes veškerou snahu ochránit psy i kočky vakcinací, stále přicházejí do ordinace nové případy očkovaného jedince nakaženého právě parvovirózou. Naše domněnka zní, že vakcína, kterou používáme je navržena jako ochrana proti jinému kmenu než tomu, který v České a Slovenské republice cirkuluje. Jako cíl této práce jsme si tedy stanovili pokusit se zodpovědět základní otázku: Jaký kmen aktuálně cirkuluje v ČR a SR. Podařilo se nám potvrdit kmen pouze u 6 vzorků CPV, ale u všech vyšel kmen CPV-2a. Jako další cíl jsme si stanovili pokusit se zavést jednoduchou metodu stanovení kmenu. Zkoušeli jsme sekvenaci Sangerovou metodou, která se nám však neosvědčila. Mohlo však jít pouze o nevhodně navržené primery. Dále jsme zkoušeli sekvenaci NGS metodou pomocí přístroje Minion, která se nám naopak osvědčila. Z 6 analyzovaných vzorků CPV jsme získali 5, u kterých bylo možné určit kmen.

Abstract:

Parvovirus is a serious gastrointestinal disease that is still prevalent in the dog and cat population. Despite all efforts to protect dogs and cats through vaccination, new cases of vaccinated dogs and cats infected with parvovirus continue to occur in practice. Our hypothesis is that the vaccine we use is designed to protect against a different strain than the one circulating in the Czech and Slovak Republics. The aim of this work was therefore to try to answer the basic question: Which strain is currently circulating in the Czech Republic and Slovakia? We were only able to confirm the strain in 6 CPV samples, but all of them showed the strain CPV-2a. We also wanted to find a simple method for strain identification. We tried Sanger sequencing, but it was not successful. However, it could simply be a case of inappropriately designed primers. We also tried NGS sequencing using the Minion method, which was successful. Of the 6 CPV samples analyzed, we obtained 5 in which the strain could be determined.

Klíčová slova

parvovirus, CPV, FPV, Sangerova metoda, NGS, vakcinace

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 31. 7. 2024

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: MVDr. Simona Kovaříková, Ph.D.

Veterinární univerzita Brno

Fakulta veterinární hygieny a ekologie

Magisterský studijní program / obor:
Ochrana zvířat a welfare / Ochrana zvířat a welfare