Komparativní genomika Treponema pallidum: cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice – Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
Doctoral thesis
Komparativní genomika Treponema pallidum: cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice
Comparative genomics of Treponema pallidum: from whole genome sequencing to diagnostic applications
Abstract:
Druh Treponema pallidum zahrnuje 3 pro člověka patogenní poddruhy. Tyto poddruhy – pallidum, pertenue a endemicum – způsobují přes velice blízkou sekvenční příbuznost onemocnění s odlišnou klinickou manifestací. Jedná se o syfilis, yaws a endemickou syfilis. Patogenní treponemata zahrnují ovšem i patogeny jiných hostitelů než člověka. Jedná se o druhově nezařazený opičí izolát Fribourg-Blanc a druh …moreAbstract:
h pro poddruh pallidum, pertenue a endemicum. Konsenzuální nukleotidové sekvence čtyř lokusů byly použity pro rekonstrukci fylogenetického stromu. Fylogenetická analýza potvrdila opodstatnění rozdělení patogenních treponemat na jednotlivé druhy a poddruhy. Nepřinesla ovšem zásadní vhled do dlouhodobé debaty o původu venerické syfilis. Srovnání genomů kmenů Nichols a SS14 odhalilo sekvenčně divergentní …moreAbstract:
Genus Treponema includes several pathogenic spirochetes. Three human pathogens include: Treponema pallidum ssp. pallidum, the causative agent of venereal syphilis; T. pallidum ssp. pertenue, the causative agent of yaws; and T. pallidum ssp. endemicum causing endemic syphilis. Non-human pathogens include: unclassified simian isolate Fribourg-Blanc and T. paraluiscuniculi. Fribourg-Blanc strain causes …moreAbstract:
led divergent loci that can be used for molecular typing of syphilitic clinical isolates. As T. pallidum can not be cultured in vitro, molecular detection of syphilitic treponemes represents the only available method for treponeme typing. In addition, macrolide antibiotic resistance in clinical isolates can be tested. Our aim was to screen divergent loci of the T. pallidum genomes and to assess the …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 11. 2009
Identifier:
https://is.muni.cz/th/cs1s7/
Thesis defence
- Date of defence: 18. 12. 2009
- Supervisor: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
POSPÍŠILOVÁ, Petra. \textit{Komparativní genomika Treponema pallidum: cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice}. Online. Doctoral theses, Dissertations. Brno: Masaryk University, Faculty of Medicine. 2009. Available from: https://theses.cz/id/smr7a5/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Lékařská fakultaMasaryk University
Faculty of MedicineDoctoral programme / field:
Medical Biology (4-years) / Medical Biology
Theses on a related topic
-
Comparative studies on Treponema pallidum: comparative genomics of yaws agents and phenomics of BAC clones of syphilis agent
Darina Čejková -
Celogenomová sekvenace, anotace a komparativní genomika tří serovarů Salmonella enterica
Václav Klíč -
Komparativní genomika hlavního histokompatibilního komplexu MHC
Martin Plášil -
Komparativní genomika skupiny Trypanosomatidae: od modelových po méně známé druhy
Amanda Tábita DA SILVA ALBANAZ -
Komparativní genomika nekultivovatelných patogenních treponemat: identifikace genetických rozdílů mezi původci syfilis a yaws
Marie Zobaníková -
Komparativní genomika hlavního histokompatibilitního komplexu (MHC) u čeledi Equidae: gen kódující tumor-nekrotizující faktor (TNF) alfa
Aneta Baumeisterová -
Komparativní genomika hlavního histokompatibilitního komplexu
Aneta Baumeisterová -
Treponema pallidum in clinical isolates: from diagnostics to whole genome sequencing
Eliška Vrbová