Detekce kolizí mezi proteiny

Mgr. Filip Andres

Rigorózní práce

Detekce kolizí mezi proteiny (in Czech)

Anotace:

Výzkum v oblasti analýzy proteinů si klade za cíl zlepšit a zkvalitnit návrh chemických reakcí, které by vedly k urychlení syntézy nových léčiv v biochemii. Protože veškeré podstatné chemické reakce v živých organismech probíhají právě uvnitř proteinů, jejich prostorová analýza umožní nalézt přístupové cesty dovnitř proteinu (tunely), jimiž můžeme dopravovat substráty a produkty takovýchto chemických reakcí. Dalším krokem po spočtení takovýchto tunelů je posouzení jejich vhodnosti pro vstup dané molekuly substrátu, k čemuž slouží právě techniky pro detekci kolizí. Těmi se zabývá právě tato práce a budou rovněž tématem práce disertační.

Abstract:

The aim of the protein analysis research is to improve the design of chemical reactions which can fasten the synthesis of new drugs in the biochemical field. Proteins are structures where all the chemical reactions in live organisms undergo. The goal of the analysis is to find the entrance paths (tunnels). Then substrates or products of the reactions can be trasferred via these tunnels. The next step after the tunnel computation is the examination of their suitability for the entrance of the substrate molecule. This can be done using techniques for collision detection. These techniques form the content of this thesis and will be also the topic of the dissertation thesis.

Klíčová slova

protein, analýza, detekce kolizí protein, analysis, collision detection

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 6. 2008

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 23. 6. 2008

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Rigorózní řízení / obor:
Informatika / Informatika