Genetické mapování a jeho využití pro poziční klonování genu rezistence ke mšici zhoubné u pšenice

Karolína WOJEWODOVÁ

Bakalářská práce

Genetic mapping and its application in positional cloning of a Russian wheat aphid resistance gene in wheat

Anotace:

Pšenice setá (Triticum aestivum L.) patří mezi nejvýznamnější zemědělské plodiny na světě a pro více než 30% světové populace představuje základní zdroj potravy. Se zvětšujícím se počtem lidí zároveň stoupají i nároky na kvalitu a vlastnosti této plodiny, nicméně, studium pšenice je znesnadněno velikostí jejího genomu a přítomností tří homeologních subgenomů (A, B, D). K významným ztrátám při pěstování pšenice dochází působením mšice zhoubné. Jelikož je mšice zhoubná odolná vůči působení pesticidů je vhodnou alternativou pěstování rezistentních odrůd vůči tomuto škůdci. Předkládaná práce je zaměřena na genetické mapování v oblasti genu Dn2401, podmiňujícího rezistenci ke mšici zhoudné (Diuraphis noxia, Kurdjumov), který se nachází na krátkém rameni chromozómu 7D pšenice. Konstrukce vysoko-hustotní genetické mapy je důležitým krokem procesu pozičního klonování, jehož cílem je izolace studovaného genu. V rámci experimentální části předkládané bakalářské práce byl zamapován nový marker Xowm714 v rámci mapovací populace CI2401/Glupro-F2, s cílem zmenšit interval mezi hraničními markery Xowm711 a Xowm713 (Mazáčová, 2016). Zároveň byl v oblasti mezi markery Xowm713 a Xowm714 nalezen nový rekombinant CI2401/Glupro-F2-1-38.

Abstract:

Bread wheat (Triticum aestivum) is one of the most agriculturaly important crops species in the world and it is also a staple food for more than 30 % of world human population. At the same time with the growing population, demands on the wheat quality and characteristics increase. However, studying of wheat genome is hampered by its huge genome size and presence of three homoeologous subgenomes (A, B and D). Russian wheat aphid (Diuraphis noxia, Kurdjumov) causes huge loss in wheat cultivation. Russian wheat aphid is rezistive against pesticides, so the right alternativ is breeding rezistant variety. Presented thesis is focused on genetic mapping of Dn2401 gene underlying a resistence to the Russian wheat aphid, which is located on the short arm of chromosome 7D. Construction of high-density genetic map represents important step in the proces of positional clonning which leads to the isolation of the gene of interest. Within the aims of this thesis, a new marker Xowm714 has been mapped in population CI2401/Glupro-F2, to shorten the distance between flanking markers Xowm711 and Xowm713 (Mazáčová, 2016). Between markers Xowm713 and Xowm714 has been found a new recombinant CI2401/Glupro-F2-1-38.

Klíčová slova

Pšenice setá, mšice zhoubná, rezistence, genetické mapování, poziční klonování

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 8. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Zuzana Tulpová

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie