Populační genetická struktura Euroasijských krtků

Iva Bernáthová

Bakalářská práce

Population genetic structure of Eurasian Talpids

Anotace:

Krtci jsou skupinou výhradně fosoriálních (pod zemí žíjících) savců obývajících evropský kontinent, Asii a přilehlá souostroví. Kvůli podzemnímu způsobu života a své morfologické uniformitě jsou řídce prozkoumanou skupinou. Krtek evropský (Talpa europea; Eulipotyphla: Talpidae) je nejúspěšnějším druhem z celé skupiny krtků. Krtek evropský, na rozdíl od většiny podzemních savců, obývá vlhké lesy a louky mírného pásu, které byly silně ovlivněny změnami klimatu, především během pleistocénu. Cílem studie bylo zhodnocení populační struktury, variability a velikosti efektivní populace krtka evropského ve střední Evropě pomocí molekulárních metod. Celkem bylo osekvenováno 40 vzorků a do analýzy zahrnuto kontrolní oblast mtDNA, sekvence byly editovány a dále analyzovány. V datasetu byly pomocí landscape genetic nalezeny dvě populace - západní a východní. Celkově populace vykazovala vysokou haplotypovou diverzitu, počet identifikovaných haplotypů byl 23. Tvar haplotypové sítě, testy neutrality a další parametry ukazují na demografickou expanzi, která v populaci v minulosti proběhla nebo na purifikující selekci.

Abstract:

Moles are a group of strictly subterranean mammals occupying most of the european continent, Asia and nearby islands. Due to their fossoriality and external uniformity, the information on moles are scarce. The european mole Talpa europea (Eulipotyphla: Talpidae) is the most successful species of this group. European mole prefers, unlike most fossorial mammals, humid forests and meadows which were strongly under influence of climate changes, mostly during Pleistocene. The aims of the study were to analyze population structure, variability and effective population size of european mole population in the Middle Europe using molecular methods. 274 bp long mitochondrial control region of 40 samples of Talpa europea was included in the analysis. Using landscape genetic method, two populations (western and eastern) in the dataset were found. Population showed high hyplotype diversity, the number of identified haplotypes was 23. The structure of haplotype network, the results of neutrality tests and other parametres showed demographic expansion, which the population undergone in the past, or purifying selection.

Klíčová slova

genetická variabilita, krtci, mitochondriální DNA, populační genetika, Talpa europea, fylogeneze

Keywords

genetic variability, mitochondrial DNA, moles, phylogeny, population genetics, Talpa europaea

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Barbora Černá Bolfíková, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta tropického zemědělství

Bakalářský studijní program / obor:
Zemědělská specializace / Zemědělství tropů a subtropů