Bc. Jiří MORAVEC

Master's thesis

Computational Framework for Protein-Protein Docking Prediction and Experimental Design

Abstract:
This work focuses on creating an interface for protein interactions and experimental design. It provides basic information about protein structures, neural networks in general, and specifically focuses on the structure of the Transformer model. Additionally, it includes information on modern artificial intelligence systems for protein structure predictions, such as ESMFold and AlphaFold. The thesis …more
Abstract:
Tato práce se zabývá vytvořením rozhraní pro proteinové interakce a experimentální design. Poskytuje základní informace o proteinových strukturách, neuronových sítích obecně a detailněji se zaměřuje na strukturu Transformer. Dále obsahuje informace o moderních systémech umělé inteligence pro predikce proteinových struktur jako jsou ESMFold a AlphaFold. Představuje metody pro použití těchto modelů v …more
 

Keywords

neuronové sítě transformer umělá inteligence metacentrum syntetická biologie proteiny ESMFold AlphaFold docking velké jazykové modely predikce framework interakce
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 8. 2024
Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

  • Supervisor: Doc. Daniel Georgiev, PhD.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

MORAVEC, Jiří. Computational Framework for Protein-Protein Docking Prediction and Experimental Design. Plzeň, 2024. diplomová práce (Ing.). ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI. Fakulta aplikovaných věd

Full text of thesis

Accessibility: Autor si nepřeje zpřístupnění práce veřejnosti

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • Soubory jsou nedostupné.
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI, Fakulta aplikovaných věd
Vázaný výtisk práce naleznete v Univerzitní knihovně ZČU, více na http://www.knihovna.zcu.cz/kvalifikacni-prace/
https://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=96359 Reference to the local database file of the institution