Studium signálních drah u buněčné linie derivované z multiformního glioblastomu se ztrátou kopie genu EGFR

Mgr. Jan Škoda, Ph.D.

Advanced ('rigorózní') thesis

Analysis of signaling pathways in glioblastoma cell line with a loss of EGFR gene copy

Abstract:

Tato práce navazuje na předchozí výzkum Laboratoře nádorové biologie, v rámci kterého byl publikován případ pacienta s multiformním glioblastomem s netypicky mírným klinickým průběhem onemocnění, kdy v nádorové tkáni i buněčné linii HGG-02, derivované z příslušného nádoru, byla detekována ztráta kopie genu EGFR. Cílem této práce bylo proto provedení detailní analýzy buněčné linie HGG-02 se zaměřením na aktivitu signálních drah. Výsledky fosforylačních analýz, RT-PCR a expresního profilování u buněčné linie HGG-02 byly vztaženy k referenční glioblastomové buněčné linii GM7 derivované z vysoce agresivního glioblastomu. Na základě této analýzy bylo potvrzeno snížení exprese EGFR a signalizace prostřednictvím tohoto receptoru. Zároveň byly identifikovány cílové molekuly, které mohly přispět k neobvykle nízce agresivnímu fenotypu původního glioblastomu, z něhož byla linie HGG-02 derivována. Zejména TAM receptory, Trk receptory a receptory PDGF představují dle získaných výsledků vhodné kandidáty pro další výzkum glioblastomu a lepší pochopení funkce těchto receptorů a s nimi spřažených signálních drah by mohlo přispět k objasnění biologické podstaty gliomageneze a napomoci přesnější stratifikaci pacientů dle rizika.

Abstract:

This thesis builds on the research of Laboratory of tumor biology and previously published case study of glioblastoma multiforme patient with an unusually favorable course of the disease. In the study, the loss of EGFR gene copy in a tumor tissue and HGG-02 cell line derived from the respective tumor was reported. The aim of this thesis was to perform detailed analysis of HGG-02 cell line with the focus on signaling pathways activity. The results of phospho-RTK and phospho-MAPK arrays, RT-PCR and gene expression profiling of HGG-02 cell line were compared to those for reference GM7 glioblastoma cell line derived from a very aggressive glioblastoma. Based on this analysis, the downregulation of EGFR expression as well as lowered EGFR signaling was confirmed. Moreover, several targets that could contribute to the unusally non aggressive phenotype of the respective tumor were identified in HGG-02 cell line. As indicated by these results, TAM receptors, Trk receptors and PDGFRs need to be further investigated. A better understanding of the function of these receptors and their respective signaling pathways could contribute to elucidate the biology of gliomagenesis and may help risk stratification of glioblastoma patients.

Keywords

multiformní glioblastom, glioblastoma multiforme, EGFR, PDGFR, TAM receptory, TAM receptors, signální dráhy, signaling pathways, RTK, MAPK

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 10. 2014

Thesis defence

• Date of defence: 19. 12. 2014
• Reader: MUDr. Iva Zambo, Ph.D., Mgr. Jan Bouchal, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Advanced ('rigorózní řízení') programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics