Semi-automatic segmentation of microscopy images – Bc. Jana Navrkalová
Bc. Jana Navrkalová
Bachelor's thesis
Semi-automatic segmentation of microscopy images
Semi-automatic segmentation of microscopy images
Abstract:
Tato práce se zabývá segmentací obrazu. Hlavním cílem této práce bylo prozkoumat semi-automatické nástroje pro segmentaci obrazů buněk se složitým tvarem, porovnat nástroje s manuálními a doporučit vhodný semi-automatický nástroj pro účely Cell Tracking Challenge (CTC). Segmentovali jsme dvou dimenzionální mikroskopické obrazy buněk se složitým tvarem z CTC datasetů ve vybraných aplikacích a nástrojích …moreAbstract:
This work deals with image segmentation. The main goal of this thesis was to investigate semi-automatic tools for segmentation images of cells with complex shapes, compare them with manual tools, and recommend suitable tools for the purpose of the Cell Tracking Challenge (CTC). We segmented two-dimensional microscopy images with complex shapes from the CTC datasets in selected applications and tools …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 12. 2021
Identifier:
https://is.muni.cz/th/y3aeg/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 2. 2022
- Supervisor: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Informatics / Informatics
Theses on a related topic
-
Semi-automatic tools for image segmentation
Martin Moučka -
Využití stromových struktur pro semi-automatickou segmentaci obrazů živých buněk
Tomáš Nesvadba -
Evaluation Of Instance Segmentation Methods For Electron Microscopy Images with focus on throughput and speed
Roman Ďuriš -
Cell segmentation from wide-field light microscopy images using CNNs
Ali GHAZNAVI