Vliv vybraných kandidátních lokusů na ukazatele jakosti masa u skotu

Bc. Halina STEBLOVÁ

Master's thesis

Effect of selected candidate loci on meat quality indicators by cattle

Abstract:

Tato práce byla zaměřena na analýzu polymorfismu v 2141. pozici v exonu 5 genu růstového hormonu (GH) a polymorfismu v 257. pozici v exonu 10 genu pro receptor růstového hormonu (GHR) a na stanovení vlivu těchto polymorfismů na křehkost masa. K analýze bylo využito 333 vzorků masa býků plemene českého strakatého skotu. Genotypizace lokusů GH a GHR byla provedena metodou PCR-RFLP. Pro odhalení jednonukleotidového polymorfismu byla u obou genů použita restrikční endonukleáza AluI. Pro určení křehkosti masa byla použita metoda měření síly ve střihu podle Warnera a Bratzlera. Hodnoty síly ve střihu vzorků syrového masa byly naměřeny 14. den po porážce. Poté byl statisticky vyhodnocen vztah mezi genotypy a sílou ve střihu. Ve sledované populaci se pro lokus GH vyskytovalo 166 jedinců s genotypem LL, 161 heterozygotů LV a 6 homozygotů VV. Relativní frekvence genotypů tedy byly 0,499 (LL), 0,483 (LV) a 0,018 (VV). Frekvence alely L byla 0,74 a alely V byla 0,26. Pro lokus GHR bylo ve sledované populaci zjištěno 178 homozygotů AA, 105 heterozygotů AG a 50 homozygotů GG. Relativní frekvence genotypů byly 0,535 (AA), 0,315 (AG) a 0,15 (GG). Frekvence alely A byla 0,692 a alely G byla 0,308. Pomocí statistické analýzy byl zjištěn významný vliv genotypu genu GH na sílu ve střihu, respektive křehkost (P<0,05). Pro lokus GHR nebyl zjištěn žádný vliv genotypu na sílu ve střihu (P>0,05).

Abstract:

This study was aimed on analysis of polymorphism at position 2141 in exon 5 of the growth hormone gene (GH) and polymorphism at position 257 in exon 10 of the growth hormone receptor gene (GHR) and to determine the influence of these polymorphisms on meat tenderness. To analysis has been used 333 meat samples of Czech Pied bulls. Genotypization of GH and GHR loci was performed by PCR-RFLP. For detection of single nucleotide polymorphism in both genes was used restriction endonuclease AluI. To determine meat tenderness was used the method of measuring shear force by Warner and Bratzler. The shear force values of raw meat samples were measured at day 14 post mortem. Then was statistically evaluated the association between genotypes and shear force. In the study population occurred for GH locus 166 individuals with genotype LL, 161 heterozygotes LV and 6 homozygotes VV. The relative genotype frequencies were thus 0.499 (LL), 0.483 (LV) and 0.018 (VV). The frequency of L allele was 0,74 and of V allele was 0,26. For GHR locus was found in the study population 178 homozygotes AA, 105 heterozygotes AG and 50 homozygotes GG. The relative frequencies of genotypes were 0.535 (AA), 0.315 (AG) and 0.15 (GG). The frequency of A allele was 0,692 and of G allele was 0,308. Using statistical analysis revealed a significant effect of genotype GH gene on shear force, tenderness resp. (P<0,05). For GHR locus showed no effect of genotype on shear force (P>0,05).

Keywords

kandidátní gen, gen růstového hormonu, gen pro receptor růstového hormonu, genetický marker, jakost masa, křehkost, PCR/RFLP

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 11. 2014

Accessible from:: 30. 11. 2014

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Lenka Hanusová, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Agriculture

Master programme / field:
Agriculture Engineering / Animal Biotechnology