Bc. Katarína Martinová

Master's thesis

Algorithms for shortest superstring problems

Algorithms for shortest superstring problems
Abstract:
Problém najkratšieho spoločného nadreťazca je NP-úplný problém. Je to veľmi dôležitý problém pre výskum DNA a iné oblasti. Výskum sa sústreďuje na aproximáciu riešenia tohto problému. V práci sú popísané a implementované dva už publikované aproximatívne algoritmy. Sú tiež testované na rôznych sadách dát.
Abstract:
Shortest Common Superstring problem is NP-complete problem. It is very important problem for DNA research and other fields. The research is concentrating on its approximation, two already published approximation algorithms are described, implemented and tested on various data sets.
 

Keywords

Shortest Common Superstring problem NP-hard problem approximation algorithm greedy algorithm DNA sequencing string problems Problém najkratšieho spoločného nadreťazca NP-ťažký problém aproximatívny algoritmus hladný algoritmus sekvencovanie DNA problémy na reťazcoch
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 8. 1. 2015
Identifier: https://is.muni.cz/th/nrg7j/

Thesis defence

  • Date of defence: 13. 2. 2015
  • Supervisor: Ph.D. Alexandru Popa
  • Reader: PhD Sebastian Ordyniak

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution