Analýza genetických změn pomocí metody arrayCGH u pacientů s mnohočetným myelomem

Bc. Šárka ŠMÍDOVÁ

Master's thesis

Analysis of genetic abnormalities using arrayCGH method in patients with multiple myeloma

Abstract:

Diplomová práce se zabývá analýzou cytogenetických změn pomocí metody komparativní genomové hybridizace na čipu (aCGH) u pacientů s mnohočetným myelomem. V teoretické části jsou zmíněny všeobecné informace o tvorbě krevních buněk a vývoji B lymfocytů. Jsou zde popsány nejčastěji se vyskytující monoklonální gamapatie se zaměřením na mnohočetný myelom. U mnohočetného myelomu jsou shrnuty příznaky, možnosti vyšetření, kritéria pro diagnózu, dále pak nejčastěji se vyskytující cytogenetické změny a metody jejich detekce. V praktické části je analyzován soubor 51 pacientů s diagnózou mnohočetný myelom, u kterého byly metodou aCGH vyšetřovány chromozomové abnormality. Změny byly detekovány u 50 pacientů. Nejčastěji detekovanými změnami bylo zmnožení celých chromozomů (30 pacientů), zmnožení dlouhých ramen chromozomu 1 (29 pacientů) a ztráty celých chromozomů (27 pacientů). Celkem 30 pacientů náleželo do skupiny s hyperdiploidním myelomem a 20 pacientů do skupiny s nonhyperdiploidním myelomem. Pro doplnění IGH translokací byly použity výsledky z analýzy metodou FICTION (fluorescence immunophenotyping and fluorescence in situ hybridization). Diplomová práce potvrdila význam metody aCGH pro analýzu cytogenetických aberací, její důležitost v kombinaci s metodou FISH a prokázala výskyt vysoce heterogenních změn u pacientů s mnohočetným myelomem, které mohou sloužit k rozdělení pacientů do prognostických skupin a ovlivnit volbu léčby.

Abstract:

This thesis deals with the analysis of cytogenetic changes using aCGH method in patients with multiple myeloma. Theoretical part summarizes basic information about blood cells formation and B cell development. Furthermore there are described the most common monoclonal gammopathies, especially multiple myeloma. In multiple myeloma symptoms, examinations options, criteria for diagnosis, the most frequently occurring cytogenetics changes and methods for their detection are summarized. The experimental part contains group of 51 patients. All of them where examined by aCGH method. Chromosomal aberrations were detected in 50 patients. The most frequently detected changes were gain of whole chromosomes (30 cases), multiplication of 1q (29 cases) and loss of whole chromosomes (27 cases). Total of 30 patients belonged to hyperdiploid myeloma and 20 patients belonged to nonhyperdiploid group. IGH translocations were analyzed using FICTION (fluorescence immunophenotyping and interphase cytogenetic as a tool for the investigation of neoplasm) method. The thesis confirmed the importance of aCGH method for analysis of cytogenetic aberrations in multiple myeloma, especially in combination with FISH method showed the occurrence of highly heterogeneous changes in multiple myeloma patients, which can divide patients into prognostic groups and may also influence the treatment approach.

Keywords

arrayCGH, FICTION, monoklonální gamapatie, MM

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 4. 2019

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Jana Balcárková, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology