Zobecněná syntéza poznatků o účinnosti kolonoskopie při prevenci kolorektálního karcinomu

Bc. Lenka Puczoková

Master's thesis

Generalised synthesis of evidence for colonoscopy effectiveness in prevention of colorectal cancer

Abstract:

Kolorektální karcinom (CRC) je celosvětově třetí nejčastěji diagnostikované nádorové onemocnění u mužů a druhé u žen. V mnoha zemích již fungují screeningové programy, které mají za cíl snižovat incidenci i mortalitu CRC. Screening většinou spočívá v provedení testu na okultní krvácení do stolice, a pokud je pozitivní, následuje screeningová kolonoskopie. Právě účinnost kolonoskopie je předmětem zájmu této práce. Přestože je považována za nejúčinnější metodu detekce CRC nebo prekancerózních polypů, nebyla její účinnost ve screeningu dosud ověřena v randomizované klinické studii. Cílem této práce je sloučit výsledky vyhledaných studií o účinnosti kolonoskopie metodou zobecněné syntézy poznatků. Jedná se o metodu podobnou metaanalýze, která je ale postavena na bayesiánském přístupu. Ve výpočtech se uplatňují Monte Carlo markovské řetězce, algoritmy, které generují náhodné vzorky z výsledného rozdělení. V databázi PubMed bylo nalezeno celkem 11 studií kvantifikujících incidenci CRC a 9 o mortalitě CRC. Byly rozděleny do 3 skupin podle výstupní veličiny (poměr šancí, relativní riziko, standardizovaný poměr incidence/mortality) a byla provedena zobecněná syntéza poznatků formou hierarchického modelu. Výsledek: Snížení incidence CRC absolvováním kolonoskopie bylo odhadnuto na 57 % (RR 0,43; 95% interval spolehlivosti (0,31 - 0,58)) a snížení mortality na 41 % (RR 0,59; 95% interval spolehlivosti (0,40 - 0,81)). Provedená zobecněná syntéza poznatků z observačních studií ukázala, že kolonoskopie zásadně snižuje riziko onemocnění kolorektálním karcinomem a rovněž riziko úmrtí na tuto chorobu.

Abstract:

Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer diagnosed in men and second diagnosed in women worldwide. Screening programs are already available in many countries, aimed to decrease the incidence and mortality CRC. Screening generally means performing the faecal-occult blood test, and if positive, followed by a screening colonoscopy. The efficiency of colonoscopy is the point of interest in this thesis. While it is considered to be the most effective method in detection of CRC or precancerous polyps, its efficiency in screening was never examined in a randomized clinical trial. The aim of this thesis is to combine the results of found studies on screening colonoscopy effectivity by a method generalized synthesis of evidence. It is a method similar to metaanalysis, but built on a bayesian approach. Markov chain Monte Carlo (MCMC) are used for computation. MCMC is a class of algotithms which generate random samples from resulting distribution. In the PubMed database, 11 studies about how colonoscopy affects the CRC incidence and 9 about CRC mortality were found. The studies were divided into 3 groups according to the output value (the odds ratio, relative risk, standardized incidence/mortality ratio) and generalized synthesis of evidence was performed in a form of hierarchical model. Results: The decrease of CRC incidence after undergoing colonoscopy was estimated to be 57 % (RR 0,43; 95% confidence interval (0,31 - 0,58)) and decrease of mortality was estimated to be 41 % (RR 0,59; 95% confidence interval (0,40 - 0,81)). Performed generalized synthesis of evidence from observational studies have shown that colonoscopy significantly reduce the risk of colorectal cancer and also the risk of death from this disease.

Keywords

Kolorektální karcinom, screening, bayesiánská statistika, hierarchický model, markovský řetězec, Monte Carlo metody, Gibbsův vzorkovač, WinBUGS Colorectal cancer, bayesian analysis, hierarchical model, markov chain, Monte Carlo methods, Gibbs sampler, WinBUGS

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 21. 5. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 17. 6. 2013
• Supervisor: RNDr. Ondřej Májek, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Mathematical Biology