Stanovení parametrů kompartmentového modelu dynamiky onkologických onemocnění

Bc. Eva Jarošová

Diplomová práce

Determination of Compartmental Model Parameters Describing Cancer Dynamics

Anotace:

Kompartmentové modely byly dlouhou dobu využívány zejména pro predikci šíření epidemických onemocnění ve velkých populacích V této práci jsme se zaměřili na jejich využití v onkologii a dále na optimalizaci těchto modelů, k čemuž jsme využili Newtonovu metodu a metodu simplexů. Naším cílem bylo dosáhnout shody reálných dat s daty predikovanými optimalizovaným modelem, popř. navrhnout změny ve struktuře modelu, které by predikci usnadnily a zpřesnily. K tomuto byla využita také citlivostní analýza parametrů. Experimentální část práce je provedena na datovém souboru platném pro diagnózy kolorektálního karcinomu, zhoubného novotvaru prsu a karcinomu plic.

Abstract:

Compartmental models are used to model the progress of epidemic in a large population. In this thesis we tried to use these models in oncology to model cancer dynamics. We tried to optimize the models in order to get good results by comparing real and our experimental data. We used the Newton´s method as well as simplex method. Second objective was to suggest the modification of model, which should be made to optimize the model more. Sensitivity analysis was a useful device helping us this way. We used the data related to diagnosis of colorectal carcinoma, malignant neoplasm of breast and lung cancer.

Klíčová slova

Kompartmentový model, optimalizace modelu, onkologické onemocnění, Newtonova metoda, metoda simplexů Compartmental model, oncological diseases, model optimization, Newton method, simplex method

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2013
• Vedoucí: prof. Ing. Jiří Holčík, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Matematická biologie