Bc. Jan Polák

Bachelor's thesis

Nasazení task-based runtime systému v 3D Fourierově rekonstrukci

Using a Task-based Runtime System with 3D Fourier Reconstruction
Abstract:
Práce vychází z existujícího počítačového programu na rekonstrukci 3D obrazů z výstupů elektronového mikroskopu. Za účelem zvýšení výkonu tento program přepisuje, aby využil výhodných vlastností task-based runtime systému StarPU. Práce ukazuje, že rozložením výpočtu na jednotlivé úlohy, je možné dosáhnout vyššího výkonu, díky lepšímu využití dostupných výpočetních zdrojů. Pro další rozvoj projektu …more
Abstract:
The work expands on an existing computer program for the reconstruction of 3D volumes from outputs of cryo-electron microscopes. The program has been rewritten to take advantage of a task-based runtime system StarPU, with the ultimate goal of performance increase. The work shows that it is possible to achieve higher utilization of computing resources, by splitting the program into smaller, independently …more
 

Keywords

task-based systém 3D Fourierova rekonstrukce optimalizace Xmipp StarPU autotuning kryo-elektronová mikroskopie paralelizace Kernel Tuning Toolkit
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2019
Identifier: https://is.muni.cz/th/yd64s/

Thesis defence

  • Date of defence: 26. 6. 2019
  • Supervisor: RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
  • Reader: Mgr. et Mgr. Jaroslav Oľha

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution