Analýza lokálních struktur in silico a jejich experimentální validace – Bc. Michal Morávek
Bc. Michal Morávek
Master's thesis
Analýza lokálních struktur in silico a jejich experimentální validace
In silico analyses of local DNA structures and its experimental validation
Abstract:
Křížové struktury a kvadruplexy jsou sekundární struktury DNA, které se často vyskytují v promotorech genů. Vznik těchto struktur reguluje průběh různých biologických procesů jako DNA replikace, oprava poškozené DNA, modelování chromatinu a dalších. Jejich tvorba je závislá na sekvenci DNA, přítomnosti specifických iontů nebo nadšroubovicovém vinutí DNA. V této práci se věnujeme studiu tvorby sekundárních …moreAbstract:
Cruciforms and quadruplexes are secondary DNA structures, which are often localized in gene promoters. Formation of these structures regulates biological processes such as DNA replication, DNA repair, chromatin modeling and more. Their formation is dependent on DNA sequence, presence of specific ions or superhelicity of DNA. In this work we study formation of secondary structures form different sequences …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2019
Identifier:
https://is.muni.cz/th/cvfb2/
Thesis defence
- Date of defence: 5. 6. 2019
- Supervisor: doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Biochemistry
Theses on a related topic
-
Rozpoznávání křížových struktur v DNA a jejich analýza in silico
Michal Morávek -
Interakce proteinu p53 s DNA: studium vlivu látek modulujících strukturu DNA, koncentrace solí a využití elektrochemických metod ke studiu protein-DNA interakcí
Peter Šebest -
Analýza DNA vazebných proteinů se zaměřením na jejich interakce s lokálními strukturami DNA
Natália Valková -
Ligandy rozpoznávající alternativní struktury DNA: studium vazby ligand-DNA v roztoku a na elektricky nabitých površích a vliv na viabilitu buněk
Petra Mikušová -
Lokální struktury DNA, jejich analýza a využití v DNA origami
Jakub Vilímek -
Vlastnosti nekanonických bázových párů v DNA a DNA/protein komplexech
Anežka Tichá -
Elektrochemické metody pro detekci interakcí DNA s proteiny a pro sledování enzymatických přeměn DNA
Monika Hermanová -
Co nám říká neandertálská DNA o Homo sapiens neanderthalensis? Mitochondriální DNA versus jaderná DNA.
Šárka Řezáčová