Bc. Michal Morávek

Master's thesis

Analýza lokálních struktur in silico a jejich experimentální validace

In silico analyses of local DNA structures and its experimental validation
Abstract:
Křížové struktury a kvadruplexy jsou sekundární struktury DNA, které se často vyskytují v promotorech genů. Vznik těchto struktur reguluje průběh různých biologických procesů jako DNA replikace, oprava poškozené DNA, modelování chromatinu a dalších. Jejich tvorba je závislá na sekvenci DNA, přítomnosti specifických iontů nebo nadšroubovicovém vinutí DNA. V této práci se věnujeme studiu tvorby sekundárních …more
Abstract:
Cruciforms and quadruplexes are secondary DNA structures, which are often localized in gene promoters. Formation of these structures regulates biological processes such as DNA replication, DNA repair, chromatin modeling and more. Their formation is dependent on DNA sequence, presence of specific ions or superhelicity of DNA. In this work we study formation of secondary structures form different sequences …more
 
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2019

Thesis defence

  • Date of defence: 5. 6. 2019
  • Supervisor: doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.

Citation record

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta