Proteomické profilování nádorové buněčné linie CEM ošetřené triterpenoidními látkami s protinádorovou aktivitou

Jiří Řehulka

Master's thesis

Proteomic profiling of CEM cancer cell line treated by triterpenoid compounds with anticancer activity

Abstract:

Tato diplomová práce je zaměřena na identifikaci molekulárních cílů potenciálních protinádorových léčiv metodami expresní proteomiky. Kyselina betulinová je triterpenoidní látka s cytotoxickými účinky namířenými specificky proti nádorovým buňkám. Některé její uměle připravené deriváty vykazují silnější cytotoxické účinky a schopnost blokovat buněčný cyklus. Teoretická část této práce popisuje základní mechanismy apoptózy i bunečného cyklu. Shrnuje také přístupy expresního profilování a hmotnostní spektrometrie proteinů. V experimentální části práce jsem studoval aktivaci kaspáz 3 a 7 v reálném čase vybranými deriváty kyseliny betulinové. Z naměřených dat byl stanoven optimální čas pro expozici buněčné linie T-lymfoblastické leukemie testovanemu derivátu JS3.786. Relativní kvantifikace proteinů ošetřené a kontrolní populace buněk byla provedena metodou metabolického značení s následnou hmotnostně spektrometrickou analýzou. V populaci buněk ošetřených J3.786 byla nepřímo zjištěna aktivace proteinu ?BH3 interacting domain death agonist?, došlo také ke zvýšení exprese podjednotky kofaktoru a chaperonu tubulinu

Abstract:

This study used an expression proteomics approach to identify molecular targets of potencial anticancer drugs. Betulinic acid is a cytotoxic compound with the specific effect to tumor cells and some of its derivates block the cell cycle progression. First part of this thesis contains basic information about the apoptosis and the cell cycle as well as about the proteomics and the mass spectrometry. In the experimental part of my thesis I studied caspase 3 and caspase 7 activation by tested compounds to determine the period of apoptosis induction. I used metabolic labeling combined with mass spectrometry to quantify changes in protein levels between cells treated by JS3.786 derivate and the control cells. JS3.786 treatment caused BH3 interacting domain death agonist activation and increase in tubulin chaperone cofactor A, chain A expression

Keywords

Apoptóza, proteomika, hmotnostní spektrometrie

Keywords

Apoptosis, proteomics, mass spectrometry

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2010

Thesis defence

• Date of defence: 8. 6. 2010
• Supervisor: Petr Džubák
• Reader: Vladimír Kryštof

Univerzita Palackého

Přírodovědecká fakulta

Master programme / field:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie