Mikrobiální osídlení nezralého novorozence

Simona GRULICHOVÁ

Master's thesis

Microbiome of the immature newborn

Abstract:

Úvod: Diplomová práce se zabývá problematikou mikrobiálního osídlení předčasně narozených dětí. Kolonizující mikrobiom úzce souvisí se zdravím jedince a s rozvojem některých komplikací a onemocnění. Cílem výzkumu v této práci bylo identifikovat vliv způsobu porodu a gestačního věku na mikrobiální kolonizaci nezralého novorozence, což může být klíčové pro minimalizaci vzniku nepříznivých zdravotních stavů. Metodika: Byla shromážděna data o vstupních mikrobiálních kultivačních stěrech (krk- nos, axila, ucho, rektum) celkem od 207 novorozenců s porodní hmotností pod 1500 g. U 139 dětí byla sesbírána další data o pozitivních kultivačních nálezech identifikovaných ve stěrech zrekta během prvního měsíce života. Sběr dat proběhl v rámci oddělení Novorozenecké JIRP ve FNOL. Statistická analýza byla provedena pomocí statistického software R, ver. 3.5.2. s použitím t-testu, chí-kvadrát testu a McNemarova testu. Hladina statistické významnosti byla stanovena na 5 %. Výsledky: U dětí po vaginálním způsobu porodu bylo identifikováno vyšší množství pozitivních nálezů vkožních stěrech. Obecně u všech nezralých novorozenců dominovaly kmeny Firmicutes a Proteobacteria. Vliv způsobu porodu na mikrobiální osídlení novorozence byl významný v prvních dnech po porodu, v průběhu dalších 4 týdnů se minimalizoval. Mikrobiální osídlení výzkumných skupin rozdělených dle gestačního věku bylo velmi podobné, i přes to však byly detekovány drobné variace ve vstupních stěrech. Nicméně při zkoumání této skutečnosti nebyly rozdíly natolik signifikantní, jako při sledování způsobu porodu. Závěr: Vtomto výzkumu byla prokázána souvislost mezi způsobem porodu a mikrobiálním osídlením nezralého novorozence bezprostředně po porodu. Během prvního měsíce života se rozdíly způsobené odlišným způsobem porodu snížily. Tyto data korelují s dalšími provedenými studiemi v rámci dané problematiky. Pozorovali jsme také variace v mikrobiálním profilu v závislosti na gestačním věku, ale nelze znich jednoznačně vyvozovat souvislost mezi gestačním stářím nezralého novorozence a jeho mikrobiálním osídlením.

Abstract:

Background: The thesis deals with the issue of microbial colonization of premature infants. Aberrant microbiome is linked to the development of certain complications and diseases, understanding this issue may be crucial to minimizing the occurrence of these adverse health consequences. The aim of the research in this thesis was to identify the effect of mode of delivery and gestational age on microbial colonization of the immature neonate. The data acquired may help to better understand this issue. Methods: Data of the initial microbial culture swabs (nose-neck, axilla, ear, rectum) from 207 preterm neonates with birth weight below 1500 g were collected. Additional data were collected for 139 infants with positive culture findings identified in rectal swabs during the first month of life. Data collection was performed within the neonatal ICU department at the FNOL. Statistical analysis was performed usin software R, ver. 3.5.2. using t-test, chi-square test and McNemar test. The signifikance treshold was 5 %. Results: A higher number of microorganisms in skin swabs were identified innewborns after vaginal delivery. In general, bacterial phyla Firmicutes and Proteobacteria were dominant in all immature neonates. The effect of mode of delivery on the microbial colonization of the newborn was significant in the first few days after delivery. It was minimized during the next 4 weeks. The microbial population of the study groups divided according to gestational age was very similar, however, slight variations were detected in the initial swabs. However, when this was examined, the differences were not as significant as when the mode of delivery was observed. Conclusion: In this study, the effect of mode of delivery on microbial colonization of the immature neonate immediately after birth was demonstrated, but minimized during the first month of life. These findings correlate with results of other previous research. We also observed variations in the microbial profile depending on gestational age, but no clear association between the gestational age of the immature newborn and its microbial colonization can be inferred.

Keywords

mikrobiom, nezralý novorozenec, předčasně narozený novorozenec, způsob porodu, gestační věk

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2024

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Soňa Šuláková

Palacký University Olomouc

Faculty of Health Sciences

Master programme / field:
Intensive Care in Midwifery / Intensive Care in Midwifery