Molekulární charakteristika profágů a jejich role v patogenitě stafylokoků

Mgr. Daniela Mináriková

Bakalářská práce

Molecular characteristics of prophages and their role in patogenicity of staphylococci

Abstract:

In this thesis I describe molecular characterization and role of bacteriophages in pathogenicity and genome diversity of staphylococci. Phages that integrate into the genome of the host bacterium (known as prophages) convert phenotype of nonpathogenic staphylococci to production of enterotoxins (causing food poisoning and TSS), exfoliatins (causing SSSS), cytotoxins (causing lethal hemolytic pneumonia in children) and immune modulators. In the mechanism of horizontal gene transfer known as generalized transduction phages serve as vectors for virulence and resistance genes located on the chromosome or plasmids. Most of the strains carry one to four prophages in their genome. In this thesis I present results of in silico analysis of complete genomes of 29 strains of Staphylocococcus aureus and 9 strains of six other staphylococcal species with aim to identify prophages in each genome.

Abstract:

Ve své bakalářské práci se věnuji molekulární charakteristice a významu bakteriofágů v patogenitě a genomové diverzitě stafylokoků. Fágy, které se integrují do genomu bakterie (profágy), mění fenotyp nepatogenních stafylokoků k produkcí enterotoxinů (způsobují otravu jídlem, TSS), exfoliatinů (způsobují SSSS), cytotoxinů (způsobují smrtelnou hemolytickou pneumonii u dětí) a imunomodulátorů. Fágy slouží jako vektory pro horizontální přenos chromozomálních a plazmidových genů virulence a rezistence v procesu známém jako generalizovaná transdukce. Většina kmenů obsahuje ve svém genomu jeden až čtyři profágy. V bakalářské práci uvádím výsledky in silico analýzy kompletních genomických sekvencí 29 kmenů Staphylococcus aureus a 9 kmenů dalších šesti stafylokokových druhů s cílem zjistit přítomnost profágů v každém z genomů.

Klíčová slova

bakteriofág, horizontální přenos genů, lyzogenní konverze, mobilní genetické elementy, patogenita, profág, Staphylococcus aureus, stafylokoky, typizace, bacteriophage, horizontal gene transfer, lysogenic conversion, mobile genetic elements, pathogenicity, prophage, staphylococci, typing

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2012
• Vedoucí: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.
• Oponent: Mgr. Marian Varga, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika