Bc. Štěpán Řihák

Bachelor's thesis

Prostate Cancer Prediction with Graph Neural Networks

Prostate Cancer Prediction with Graph Neural Networks
Abstract:
V této bakalářské práci trénujeme a vyhodnocujeme grafové neuronové sítě pro predikci rakoviny v prostatické tkáni. Pomocí předtrénované konvoluční sítě převádíme digitální snímky tkáně na grafy, kde uzly grafu odpovídají malému výřezu z velkého digitálního snímku. V experimentech porovnáváme grafové sítě, které pro klasifikaci každého uzlu používají informace z ostatních uzlů, se základním klasifikátorem …more
Abstract:
In this thesis, we train and evaluate graph neural networks for the prediction of cancer in prostate tissue. Using a pre-trained convolutional network, we convert digitized tissue slides to graphs, where the nodes represent a small tile cut out of the large digital slide. In the experiments, we compare graph networks, which learn a richer representation for each node from other nodes, with a baseline …more
 

Keywords

cancer classification digital pathology machine learning graphs graph neural networks
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2024
Identifier: https://is.muni.cz/th/hn4nl/

Thesis defence

  • Date of defence: 24. 6. 2024
  • Supervisor: RNDr. Vít Musil, Ph.D.
  • Reader: RNDr. Filip Lux

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution