Interakce proteinů s DNA se zaměřením na i-motivy

Bc. Veronika Bosáková

Diplomová práce

DNA-protein interactions with a focus on i-motives

Anotace:

Tato diplomová práce se zabývá studiem alternativních sekundárních struktur DNA se zaměřením na i-motivy. Tyto struktury mohou být tvořeny sekvencemi bohatými na cytosiny. Takové sekvence se nachází po celém genomu, například v oblastech telomer nebo v promotorech genů. V rámci této práce byla zkoumána schopnost tvořit i-motiv sekvencemi ATXN2L a Hif1⍺S v závislosti na pH prostředí. Dále bylo zkoumáno, zda jsou tyto struktury schopny interakce s proteinem p53, který je také nazýván strážce buňky.

Abstract:

This diploma thesis deals with the study of alternative secondary DNA structures with a focus on i-motives. These structures may be formed by cytosine-rich sequences. These sequences are found throughout the genome, they may be in the telomere region or in gene promoters. In this work, the possibility of creating i-motives of sequences ATXN2L and HIF1⍺S and depending on the pH of the environment was investigated. Others have been investigated to determine whether these structures are capable of interacting with the p53 protein, which is considered a cell guardian.

Klíčová slova

I-motivy, DNA, Sekundární struktura, Protein p53, Hif1⍺, ATXN2L, Nádor, Nádorový supresor, Promotor, Telomery

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 7. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 9. 2020
• Vedoucí: doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Iva Kejnovská, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika