Zjemnění Delaunayovy triangulace molekulárních struktur – Bc. Pavel Němec
Bc. Pavel Němec
Master's thesis
Zjemnění Delaunayovy triangulace molekulárních struktur
Refinement of Delaunay Triangulation of Molecular Structures
Abstract:
Tato práce se zabývá algoritmy pro analýzu proteinových struktur, jež mají uplatnění především při vývoji nových léků. Konkrétně se práce věnuje metodám pro výpočet proteinových tunelů založených na principu Delaunay triangulace a míře znepřesnění, kterou se aplikací těchto metod dopouštíme. Tento typ algoritmů totiž implicitně předpokládá, že velikosti všech atomů v molekule jsou si rovny. Navrženy …moreAbstract:
This thesis is about algorithms for analyzing protein structure which is useful especially for medical purposes. This thesis is focusing especially on methods for finding tunnels in proteins based on Deluanay triangulation. The main problem of this kind of methods is assumption that all atoms are the same size. In this thesis there are designed two methods for extension of Deluanay triangulation so …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 5. 2012
Identifier:
https://is.muni.cz/th/zccti/
Thesis defence
- Date of defence: 26. 6. 2012
- Supervisor: RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- Reader: doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
-
Tunely v proteinech – analýza dostupných informací
Šimon Dobias -
Detekce kolizí mezi proteiny
Filip Andres -
Systém na integraci bioinformatických nástrojů pro analýzu tunelů v proteinech
Jan Štourač -
Metody pro identifikaci biologicky relevantních tunelů v proteinech
Ondřej Vávra -
Automatický doking ligandu do tunelu v proteinu
Jan Plhák -
Studium a inženýrství tunelů v proteinech
Robin Nemeth -
Detekce asymetrických tunelů v proteinech pomocí Voroného diagramu
Jakub Vallo