Vliv peptidového ohybu na formování membránových pórů – Bc. Alžběta Türková
Bc. Alžběta Türková
Master's thesis
Vliv peptidového ohybu na formování membránových pórů
Effect of peptide kink on formation of membrane pores
Abstract:
Antimikrobiální peptidy (AMP) se řadí k rozsáhlé skupině membránově aktivních látek. AMP mohou narušit membránu cizorodých organismů vytvořením membránového póru. V současné době se AMP staly atraktivními předlohami pro vývoj nových antibiotik. Tato práce si klade za cíl objasnit proces formování membránových pórů pomocí přístupů výpočetní chemie. Zaměřujeme se na AMP s α-helikální strukturou a efekt …moreAbstract:
Antimicrobial peptides (AMPs) belong to a broad group of membrane-active compounds. AMPs can disrupt membrane of foreign organisms through the formation of membrane pores. AMPs have thus become attractive drug templates in the development of new antibiotics. Presented study aims to elucidate the process of pore formation by means of computational chemistry. We are particularly interested in AMPs with …moreKeywords
antimikrobiální peptidy helikální ohyb tvorba póru biologické membrány výpočetní chemie Monte Carlo molekulová dynamika výpočty volných energií soft matter Wang-Landau metoda umbrella sampling hrubozrnný model PSC model Cookův a Desernův model antimicrobial peptides helical kink pore formation biological membranes computational chemistry molecular dynamics free energy calculations Wang-Landau method coarse-grained model Cooke and Deserno model
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2017
Identifier:
https://is.muni.cz/th/odyng/
Thesis defence
- Date of defence: 12. 6. 2017
- Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Biomolecular Chemistry
Theses on a related topic
-
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Adsorpce antimicrobiálních peptidů na fosfolipidové membrány
Adam Dobiáš -
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
MD simulace inkluzních komplexů koordinačních sloučenin d-prvků pro výpočty NMR stínění
Jakub Jakubec -
Predicting supramolecular Interactions and Properties of Systems by Methods of Computational Chemistry
Matúš Durec -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Molekulová dynamika cyklin-dependentních protein kinas
Iveta Bártová -
Dynamika organických látek v rybničních ekosystémech
Iva TOMKOVÁ