Oxford Nanopore sekvenování a jeho využití pro analýzu struktury rostlinných genomů

Johana RICHTEROVÁ

Bakalářská práce

Application of Oxford Nanopore sequencing for genome structure analysis in plants

Anotace:

Předložená bakalářská práce se věnuje Oxford Nanopore sekvenování a jeho využití pro analýzu struktury rostlinných genomů. Teoretická část práce pojednává o sekvenačních technologiích, které se v poslední době extrémně rozvinuly a o Oxford Nanopore sekvenování a jeho využití pro analýzu struktury rostlinných genomů. Cílem praktické části byla izolace vysokomolekulární DNA z cizrny beraní (Cicer arietinum), která se vyznačuje vyšší přítomností polysacharidů. Vysokomolekulární DNA je nezbytná pro získání dlouhých čtení pomocí této technologie.

Abstract:

The submitted bachelor thesis is dedicated to Oxford Nanopore sequencing and its use for genome structure analysis. The theoretical part of the paper deals with sequencing technologies that have developed extremely recently and with Oxford Nanopore sequencing and its use for genome structure analysis. The aim of the practical part was to isolate the high-molecular weight DNA from chickpea (Cicer arietinum), which is characterised by a higher presence of polysaccharides. High-molecular weight DNA is necessary to obtain long reads using this technology.

Klíčová slova

sekvenování, vysokomolekulární DNA, izolace DNA

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie