Telomer-vazebné proteiny a jejich subcelulární funkce

Alžbeta Kusová

Bakalářská práce

Telomere-binding proteins and their subcellular function

Abstract:

Telomeres are nucleoprotein structures situated at the end of linear eukaryotic chromosomes. The telomerase enzyme is localised in proximity to telomeres and is composed of two subunits: telomerase RNA (TR) and telomerase reverse transcriptase (TERT). The main function of telomerase is the protection and elongation of telomeres. However, it is assumed that telomerase has also some non-telomeric functions, such as the regulation of cell cycle. The protection of telomeres involves also some other proteins and protein complexes. In animal cells, Shelterin is a well characterised protein complex which protects telomeres. This bachelor thesis deals with telomere-binding proteins of Arabidopsis thaliana and Physcomitella patens plants, specifically telomere-repeat bonding (TRB) proteins, belonging to single-Myb-histone (SMH) group. These proteins have a similar function to the function of Shelterin complex in animal cells. The aim of this thesis is to obtain double mutants TRB1-TERT suitable for further analysis of the telomere regulation process in A. thaliana, as well as the preparation of recombinant DNA telomere-repeat binding proteins for cloning and a further characterisation of these proteins in P. patens.

Abstract:

Teloméry sú nukleoproteínové štruktúry nachádzajúce sa na koncoch lineárnych eukaryotických chromozómov. V oblasti telomér sa nachádza enzým telomeráza, ktorý je tvorený dvomi podjednotkami: telomerázovou RNA (TR) a telomerázovou reverznou transkriptázou (TERT). Jeho hlavnou úlohou je ochrana a predlžovanie telomér. Avšak predpokladá sa, že telomeráza má i mnoho netelomerických funkcií spojených napríklad s reguláciou bunkového cyklu. Na ochrane telomér sa však podieľa i veľké množstvo iných proteínov či proteínových komplexov. U živočíchov túto funkciu vykonáva proteínový komplex nazývaný Shelterin. V tejto bakalárskej práci sa venujem telomér-väzbovým proteínom rastlín Arabidopsis thaliana a Physcomitrella patens, konkrétne telomere-repeat binding (TRB) proteínom patriacich do single-Myb-histone (SMH) skupiny. Tieto proteíny zastávajú u rastlín podobnú funkciu ako proteíny Shelterin komplexu. Cieľom tejto práce bolo získanie dvojitých mutantov TRB1-TERT vhodných pre ďalšie analýzy procesov spojených s reguláciou telomér u rastliny A. thaliana a taktiež príprava rekombinantnej DNA telomere-repeat binding proteínov pre klonovanie a následnú charakterizáciu týchto proteínov u rastliny P. patens.

Klíčová slova

teloméry, telomeráza, telomér-väzbové proteíny, TRB proteíny, Arabidopsis thaliana, Physcomitrella patens, kríženie, telomeres, telomerase, telomere-binding proteins, TRB proteins, cross

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2018
• Vedoucí: Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Radka Dopitová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie