Využití metod pozičního klonování při charakterizaci mutací involuta,cupuliformis a lucida Arabidopsis thaliana L.(Heynh.)

Bc. Ondřej Štěpánek, Ph.D.

Diplomová práce

Anotace:

Modelová rostlina Arabidopsis thaliana je široce využívána k identifikaci a lokalizaci jednotlivých genů a určování jejich funkcí prostřednictvím klasické i inzerční metageneze. V rámci obou přístupů se uplatňují metodiky přímé i zpětné genetiky. V této práci byly využity tři mutantní linie A. thaliana získané klasickou mutagenezí po působení chemomutagenů, které nesou různé typy morfologických mutací (lucida, involuta, cupuliformis). Práce zahrnovala postupy pozičního klonování a identifikaci DNA makerů v těsné vazbě s mutantními alelami jednotlivých genů. Mutace byly lokalizovány do určitých oblastí na chromozomech A. thaliana a byly identifikovány kandidátní geny pro jednotlivé mutace.

Abstract:

The model plant Arabidopsis thaliana is widely used for the identification and localization of individual genes and the determination of their functions by means of both classical and insertional mtagenesis. In therms of both of these approaches, methodics of forward and reverse genetics are being applied. In this work, three mutant lines of A. thaliana obtained by classical mutagenesis after the chemomutagens treatment were used, which carry various types of morphological mutations (cupuliformis, involuta, lucida). The work included the positional cloning approaches and the identification of DNA markers closely linked with the mutant aleles of the individual genes. The mutations were localised into specific regions in chromosomes of A. thaliana and in conclusion candidate genes for the individual mutations were identified.

Klíčová slova

Arabidopsis thaliana, DNA marker, genetické mapování, morfologická mutace, molecular mapping, morphological mutation

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 5. 2006

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2006
• Vedoucí: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika