Systém pro odhad entropie a detekci struktury v biologickych sekvencich. – Bc. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Bc. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Master's thesis
Systém pro odhad entropie a detekci struktury v biologickych sekvencich.
Entropy estimation and structure detection in biological sequences.
Abstract:
Práce popisuje obecné principy určení míry entropie, detailněji se pak věnuje možnostem odhadu entropie v biologických sekvencích. V textu je prezentován nová aplikace pro kompresi proteinových sekvencí ProteinPress. Aplikace pracuje na principu kombinace statistických expertů, který vylepšuje o možnost hierarchického navazování a adaptuje jej na proteinové sekvence. Praktickou část práce představuje …moreAbstract:
This thesis describes principles of entropy rate estimation in general and focuses on methods of entropy estimation for biology sequences. New application for protein compression ProteinPress is presented. Basic principle of application is combination of statistical experts, which is improved by possibility of expert hierarchical linking and adapts it to protein sequences. Project implements ProteinPress …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2008
Identifier:
https://is.muni.cz/th/ytfjz/
Thesis defence
- Date of defence: 1. 7. 2008
- Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Reader: doc. Mgr. Pavel Rychlý, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Interakce proteinu p53 s DNA: studium vlivu látek modulujících strukturu DNA, koncentrace solí a využití elektrochemických metod ke studiu protein-DNA interakcí
Peter Šebest -
Analýza DNA vazebných proteinů se zaměřením na jejich interakce s lokálními strukturami DNA
Natália Valková -
Ligandy rozpoznávající alternativní struktury DNA: studium vazby ligand-DNA v roztoku a na elektricky nabitých površích a vliv na viabilitu buněk
Petra Mikušová -
Lokální struktury DNA, jejich analýza a využití v DNA origami
Jakub Vilímek -
Vlastnosti nekanonických bázových párů v DNA a DNA/protein komplexech
Anežka Tichá -
Elektrochemické metody pro detekci interakcí DNA s proteiny a pro sledování enzymatických přeměn DNA
Monika Hermanová -
Co nám říká neandertálská DNA o Homo sapiens neanderthalensis? Mitochondriální DNA versus jaderná DNA.
Šárka Řezáčová -
Studium afinity DNA vazebných proteinů ke kvadruplexové DNA
Jana Surmová