Hodnocení exprese genů zapojených v antioxidační obraně u Saccharomyces cerevisiae

Martin KOVAČIK

Bachelor's thesis

Evaluation of gene expression of antioxidant defence genes in Saccharomyces cerevisiae

Abstract:

Aerobní metabolismus umožnil efektivnější získávání energie a tak i rychlejší vývoj orga-nismů. S metabolismem kyslíku jsou nicméně spojeny jeho toxické vlastnosti spočívající v tendenci ke tvorbě jeho reaktivních forem. V poslední době se ukazuje, že právě reaktivní formy kyslíku jsou příčinou mnoha patologických stavů. Jejich vysoká reaktivita způsobuje oxidační poškození biomolekul, např. poškození DNA, oxidaci proteinů, nebo peroxidaci lipidů. Vůči reaktivním formám kyslíku se v průběhu evoluce vyvinula řada mechanismů souhrnně označovaných jako antioxidační obranný systém. Jeho účelem je zabránit tvorbě volných radikálů, zachytit a odstranit vzniklé radikály, popř. opravit poškozené biomolekuly. Porušení rovnováhy mezi reaktivními formami a antioxidačním obranným systémem vede k poškození organismu. Častějším případem je převaha reaktivních forem označovaná jako oxidační stres. Práce se zabývá hodnocením exprese genů, vyvolaných v reakci na oxidační stres, metodou kvantitativní PCR v reálném čase.

Abstract:

Aerobic metabolism allowed more efficient acquisition of energy and thus faster evolution of organisms. However, with oxygen metabolism its toxic properties consisting of tendency to generate its reactive species are linked. Recently it was shown, that reactive oxygen spe-cies are cause of many pathological diseases. Their high reactivity causes oxidative damage of biomolecules, such as DNA damage, protein oxidation, or lipid peroxidation. During evolution, cells developed many mechanisms known as antioxidant defense system. Its purpose is to prevent production of free radicals, scavenge and remove existing radicals, or repair damaged biomolecules. Imbalance between reactive oxygen species and antioxidant defense system leads to dam-age of the organism. A more frequent case is the overweight of reactive oxygen species known as oxidative stress. Main focus of this thesis is evaluation of gene expression, induced in response to oxidative stress, by real-time quantitative PCR.

Keywords

antioxidační obranný systém, oxidační stres, qPCR v reálném čase, reaktivní formy kyslíku, Saccharomyces cerevisiae

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 25. 4. 2016

Accessible from:: 25. 4. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 16. 5. 2016
• Supervisor: Mgr. Jiří Červeň

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Experimental Biology