Analýza interakce proteinu p53 se sekvencemi bez p53CON.

David BROŽ

Bachelor's thesis

Analysis of interactions of p53 protein with sequences not containing p53CON.

Abstract:

Nádorový supresorový protein p53 je zodpovědný za udržení integrity genomu regulací buněčného cyklu, opravou DNA nebo vyvoláním apoptózy. Funkce proteinu p53 je spojena se sekvenčně specifickou vazbou na p53CON a sekvenčně nespecifickou vazbou na otevřené lokální struktury. V rámci této práce byla studována sekvence 9-7, která neobsahuje p53CON, ale vykazuje zvýšenou afinitu vůči proteinu p53. Pro studium dané sekvence byly využity restrikční endonukleázy a enzymatická sonda - nukleáza S1. Dále pak byla studována vazba wt p53 E10 na tuto sekvenci.

Abstract:

Tumor suppressor protein p53 is responsible for maintaining the genome integrity by regulation of cell cycle, DNA repairing or by induction of apoptosis. Function of the protein p53 is associated with its sequence- specific binding to p53CON and with sequence- nonspecific binding to local open structures. In this work was studied sequence 9-7, which doesn?t contain p53CON, but shows increased affinity to protein p53. To examine this sequence, restriction endonucleases and enzymatical probe ? nucelase S1, were used. Afterwards, binding of wt p53 to this sequence was examined.

Keywords

p53, wt p53 E10, p53CON, sekvenčně specifická vazba, sekvenčně nespecifická vazba, lokální otevřené struktury, restrikční endonukleázy, enzymatická sonda

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 21. 6. 2012

Accessible from:: 21. 6. 2012

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Experimental Biology