Hodnocení časově závislých proměnných v epidemiologii zhoubných nádorů

Bc. Ivana Svobodová

Diplomová práce

Assessment of time-varying covariates in cancer epidemiology

Anotace:

Regresní modely jsou často používanými nástroji v oblasti epidemiologie zhoubných nádorů. Ve většině případů však předpokládáme konstantní hodnoty proměnných, které se do regresních modelů zahrnují, případně je vztahujeme pouze k začátku sledování. Ve skutečnosti ale různé typy dat z přirozenosti konstantní nebývají. Pokud zahrneme do modelu informace i o tom, jak se proměnné v čase pro jednotlivé subjekty mění, můžeme v modelování dosáhnout lepších výsledků, či rozšířit své metodické možnosti. Tato diplomová práce se skládá z teoretické a praktické části. Teoretická část se věnuje rešerši literatury, matematické podstatě modelování a diskutování výhod a nevýhod modelů s časově závislými proměnným. V praktické části této práce jsou vybrané modely aplikovány na reálném datovém souboru českých onkologických pacientů s renálním karcinomem, u nichž hodnotíme mimo jiné časově závislý vliv glomerulární filtrace.

Abstract:

Regression models are frequently used statistical tools in cancer epidemiology. In most cases, the variable values are assumed to be constant in time. However, some of the variables are naturally not constant in time. Involving time varying character of the variables can make the models more accurate, or can allow us to use more advanced modeling strategies. This diploma thesis composes of a theoretical and a practical part. The theoretical part deals with literature review, statistical modelling techniques from the mathematical point of view, and advantages and disadvantages of models utilizing time-dependent variables. Practical part of this thesis deals with application of selected modeling techniques on a real world dataset of the Czech renal cancer patients with time dependent glomerular filtration rate.

Klíčová slova

Časově závislé proměnné, Analýza přežití, Coxův model, Lineární regresní modelování, Smíšený lineární model, Metastatický renální karcinom, Time-varying covariates, Survival analysis, Cox’s model, Linear regression modelling, Linear mixed model, Metastatic renal cell carcinoma

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2014
• Vedoucí: RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Matematická biologie