Úloha celogenomových analýz v preimplantační genetické diagnostice

Bc. Darja Páralová

Master's thesis

Role of whole genome analyses in preimplantation genetic diagnosis

Anotácia:

Vrozené početní a strukturní změny chromozomů tvoří významnou příčinu geneticky podmíněných onemocnění u člověka. Se zavedením celogenomových analýz pomocí techniky komparativní genomové hybridizace na DNA čipech (array-CGH) se významným způsobem posunula rychlost i citlivost určování změn v počtu kopií DNA sekvencí. Cílem této diplomové práce bylo zavést a validovat metodu aCGH pro preimplantační genetické analýzy, které zahrnují vyšetření početních i strukturních chromozomových aberací v jednotlivých buňkách embrya. K tomu byly využity oligonukleotidové platformy DNA čipů 8x15K a 8x60K založených na 60-merových oligonukleotidových sondách. Naše výsledky potvrzují, že tato technologie je vhodná jak pro preimplantační genetický screening aneuploidií všech 46 chromozomů embrya, tak pro preimplantační diagnostiku nebalancovaných translokací.

Abstract:

Genomic imbalances are major cause of constitutional and acquired disorders. Recently, array comparative genomic hybridization (array-CGH) has been introduced as a rapid and high-resolution method for genome-wide detection of both benign and disease-causing copy number variations. The aim of this diploma thesis was introduction and validation of method aCGH for preimplantation genetic analysis. These analyses include detection of numerical and structural chromosomal instability in single cell genomes derived from preimplantation embryo. For this, we used 60-mer oligonucleotide-based array CGH with 8x15K and 8x60K microarrays. This technique offers new possibilities for genetic analysis of single cells in general and opens the route towards preimplantation aneuploidy screening of all 46 chromosomes and preimplantation detection of unbalanced translocations in preimplantation embryos in particular.

Kľúčové slová

preimplantační genetické analýzy, PGA, preimplantační genetická diagnostika, PGD, preimplantační genetický screening, PGS, aCGH, microarray, celogenomová amplifikace jedné buňky, single-cell WGA

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2013
• Vedúci: RNDr. Vladimíra Vallová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics