Studium variability DNA u tribu Triticeae

Nikola Vintrlíková

Bakalářská práce

The study DNA variability of tribus Triticeae

Anotace:

Tato práce je zaměřena na studium genetické variability mezi vybranými genotypy zástupců tribu Triticeae. Bylo analyzováno 9 genotypů pšenice a 2 genotypy tritordea pomocí 12 mikrosatelitních markerů. Bylo detekováno 71 alel, jejichž velikost se pohy-bovala od 110 do 260bp. Pro každý SSR marker byl též vypočten index diverzity (DI), index pravděpodobnosti (PI) a polymorfní informační obsah (PIC). Na základě statistic-kého vyhodnocení byl sestaven dendrogram. Genotypy tritordea se podařilo statisticky významně odlišit od genotypů pšenice. Dále byly analyzovány, s využitím vysoce poly-morfního markeru Xbarc077, individuální rostliny ze 2 křížení mezi pšenicí a tritordeem. Výsledky ukazují, že křížení proběhlo úspěšně pouze u jednoho souboru analyzovaných rostlin (JB1 × Elly). SSR markery jsou vhodné pro detekci genetické variability u tribu Triticeae a detekci úspěšnosti hybridizace.

Abstract:

This work is focused on the study of genetic variability of chosen genotypes of tribus Triticeae. 9 genotypes of common wheat and 2 genotypes of tritordeum by 12 microsa-tellite markers were studied. We found 71 alleles whose size ranged from 110 to 260 bp. For every SSR marker were calculated the diversity index (DI), the probability of identi-ty (PI) and the polymorphic information content (PIC). Dendrogram was constructed on base of statistical evaluation The genotypes of tritordeum were statistically significantly separated from wheat genotypes. Individual plants from 2 crosses between wheat and tri-tordeum using highly polymorphic marker Xbarc077 were analyzed. Results show that the crossing was successful only for one set of analyzed plants (JB1 × Elly). SSR markers are useful for detecting genetic variability in the Triticeae tribe and detecting the success of hybridization.

Klíčová slova

Triticeae, tritordeum, hybridizace, SSR marker, genetická variabilita

Keywords

tritordeum, SSR marker, genetic variability, hybridization, Triticeae

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. Ing. Tomáš Vyhnánek, Ph.D.
• Oponent: Zdeněk Nesvadba, externi

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Agrobiologie / Molekulární biologie a biotechnologie