Extrakce a frakcionace proteinů ze sinic

Josef POLEHŇA

Bachelor's thesis

Extraction and fractionation of proteins from cyanobacteria

Anotácia:

Sinice patří mezi nejrozšířenější organismy na Zemi. Rod Synechococcus, se kterým bylo pracováno, je jedním z dominantních druhů v oceánech i sladkovodních vodách a v podobě planktonu je významnou složkou potravního řetězce. Díky své odolnosti, která je hlavně zásluhou komplexní buněčné stěny, sinice přežívají i v náročných podmínkách. Některé druhy jsou pro svůj vysoký proteinový obsah populárními potravinovými doplňky. Tato práce se zaměřuje právě na zisk proteinů ze sinic. Bylo otestováno několik extrakčních postupů a metod vedoucích k závěru, že použití ultrazvuku může být validní a snadno dostupná cesta k docílení buněčné lýzy. Koncentrace proteinů ve vzorcích byly stanoveny BCA metodou s nejvyšším dosaženým ziskem 4,22 mg/ml, který náleží extrakci ultrazvukem za přítomnosti SDS a lysozymu. Práce pouze nastiňuje možná úskalí extrakcí a jejich závislost na zvolených podmínkách a celkovou rozsáhlost tématiky. Pro hlubší proniknutí do problematiky je třeba dalšího výzkumu, který si sinice určitě zaslouží.

Abstract:

Cyanobacteria are among the most abundant organisms on Earth. The genus Synechococcus, which has been worked with, is one of the most dominant species in the oceans and freshwater and is an important component of the food chain in the form of plankton. Thanks to their resilience, which is mainly due to their complex cell wall, cyanobacteria survive even in harsh conditions. Some species are popular food supplements due to their high protein content. This work focuses specifically on protein extraction from cyanobacteria. Several extraction procedures and methods have been tested leading to the conclusion that the use of ultrasound may be a valid and readily available route to achieve cell lysis. Protein concentrations in the samples were determined by the BCA method with the highest gain obtained being 4.22 mg/ml, which belongs to ultrasound extraction in the presence of SDS and lysozyme. This work only outlines the possible pitfalls of extractions and their dependence on the conditions chosen and the overall scope of the topic. Further research is needed to delve deeper into the subject, which cyanobacteria certainly deserve.

Kľúčové slová

Sinice, Synechococcus, buněčná lýza, extrakce proteinů, ultrazvuk, BCA metoda, SDS-PAGE

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: prof. Mgr. Marek Šebela, Dr.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry