Back to search

Blanka Chamrádová

Master's thesis

Analýza obrazových dat z optického mapování

Analysis of Images from Optical Mapping
Abstract:
Tato diplomová práce se zabývá analýzou dat vzniklých při optickém mapování přístrojem Saphyr společnosti Bionano Genomics. Na základě provedených analýz poté dále definuje vlastní postup pro převod dostupných obrazových dat do souboru formátu BNX vytvořeného společností Bionano Genomics. Navržené postupy se zabývají detekcí molekul a strukturálních variant v obrazových datech a jsou vyhodnocovány …more
Abstract:
This masters thesis deals with the analysis of data generated during optical mapping using the Saphyr system from Bionano Genomics. Based on the analyses performed, it further defines a process for converting available image data into a BNX file format created by Bionano Genomics. The proposed methods address the detection of molecules and structural variants in image data and are evaluated against …more
 

Keywords

optické mapování Bionano sekvenování DNA analýza obrazu z mikroskopie fluorescenční mikroskopie

Keywords

optical mapping Bionano DNA sequencing microscopy image analysis fluorescence microscopy
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 4. 2023
Identifier: http://hdl.handle.net/10084/150251

Thesis defence

  • Date of defence: 31. 5. 2023
  • Supervisor: Michal Vašinek
  • Reader: Marek Běhálek

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Accessibility: Plné texty vysokoškolských kvalifikačních prací obhájených na Vysoké škole báňské - Technické univerzitě Ostrava jsou uloženy v repozitáři DSpace. Přístup k plným textům mají všichni uživatelé bez omezení. Přístup je omezen pouze ve výjimečných případech, zpravidla z důvodu ochrany duševního vlastnictví. Nepřístupné práce jsou označeny jako closedAccess nebo embargoedAccess. Tištěné verze prácí jsou uloženy v Ústřední knihovně VŠB-TUO a jsou prezenčně přístupné ve studovně diplomových prací. Další nakládání s prací (kopírování, opisy, MVS)se řídí Knihovní a výpůjčním řádem Ústřední knihovny VŠB-TUO.

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • autentizovaným zaměstnancům ze stejné školy/fakulty
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: VŠB – Technická univerzita Ostrava