Mgr. Marek Havrila, Ph.D.
Doctoral thesis
Struktura a dynamika RNA
Structure and Dynamics of RNA
Abstract:
Tato disertační práce se zabývá studiem vztahů mezi sekvencí, strukturou a funkcí několika RNA motivů pomocí výpočetních metod. Funkce molekul RNA je často podmíněna přesně definovanou třírozměrnou strukturou, jejíž vznik je předurčen specifickou sekvencí. Hlavním nástrojem výzkumu jsou molekulově-dynamické simulace, které umožňují sledovat vývoj studovaného systému v čase. Ty jsou ve většině projektů …moreAbstract:
This PhD thesis is focused on the study of RNA sequence to structure relations by computational approaches. The function of RNA molecules often depends on a precisely shaped three-dimensional structure that is determined by a specific sequence. Molecular- dynamics simulations, which enables investigation of the time development of studied system, are utilized as the main instrument of this research …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 29. 8. 2016
Identifier:
https://is.muni.cz/th/izc65/
Thesis defence
- Date of defence: 30. 11. 2016
- Supervisor: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Reader: doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D., Ing. Filip Lankaš, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Biochemistry (4-years) / Biomolecular Chemistry
Theses on a related topic
-
Nucleation of water and argon in supersonic molecular beams by the molecular dynamics method
Martin Klíma -
Molekulová dynamika dvou řetězců hyaluronanu ve směsných rozpouštědlech (virtuální experiment)
Alena Kolaříková -
Molecular Modelling of Structure-Function Relationships in Enzymes
David Bednář -
Reaction mechanisms of glycosyltransferases studied by Ab Initio molecular dynamics
Pavel Janoš -
Struktura a dynamika nukleových kyselin
Viktor Illík -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Three dimensional structure determination of a biopolymer using molecular dynamics and experimental restraints measured in isotropic media and oriented phases
Josef Chmelík -
Study of Biomolecular Dynamics by NMR Spectroscopy
Pavel Kadeřávek