Antibiotický rezistom u potravin živočišného původu

Bc. Veronika Ficeriová

Diplomová práce

Antibiotic Resistome in Foods of Animal Origin

Anotace:

Teoretická část diplomové práce je orientována na antimikrobiální látky obecně i se zaměřením na použití antibiotik u hospodářských zvířat, skupiny antibiotik a jejich mechanismy rezistence. Je zde popsán genetický základ antibiotické rezistence charakterizující mobilní genetické elementy i horizontální genový přenos. Antibiotický rezistom zahrnuje všechny typy genů antibiotické rezistence a jejich prekurzory. Lze jej zkoumat pomocí tradičních nebo molekulárních metod. V praktické části diplomové práce byl pomocí PCR a následné gelové elektroforézy zkoumán výskyt genů antibiotické rezistence - blaTEM, tetA, qnrS a mcr-1, 2, 3, 4 a mcr-5 celkem u 28 vzorků chlazeného nebaleného kuřecího masa zakoupeného v maloobchodní síti ve Zlíně. K vytvoření vhodného protokolu PCR pro konkrétní gen/geny byly provedeny optimalizace pomocí gradientové PCR. Žádný z výše zmíněných genů rezistence nebyl u vzorků kuřecího masa detekován. Pro zvýšení záchytu genů rezistence u kuřecího masa lze navrhnout zvýšení počtu testovaných vzorků, optimalizaci PCR metody či případné rozšíření portfolia metod studia antibiotického rezistomu.

Abstract:

The theoretical part of the diploma thesis is focused on antimicrobial substances in general and with a focus on the use of antibiotics in livestock and poultry, groups of antibiotics and their mechanisms of resistance. Furthermore, the genetic basis of antibiotic resistance characterising mobile genetic elements and horizontal gene transfer is described here. Antibiotic resistome includes all types of antibiotic resistance genes and their precursors. It can be examined using traditional or molecular methods. In the practical part of the diploma thesis, the occurence of antibiotic resistance genes - blaTEM, tetA, qnrS and mcr- 1, 2, 3, 4 a mcr-5 was examined by PCR and agarose gel electrophoresis in a total of 28 samples of chilled unpackaged chicken meat purchased in a retail network in Zlín. Gradient PCR optimizations were performed to create a suitable PCR protocol for a particular gene/genes. None of the above-mentioned resistance genes have been detected in chicken samples. To increase the capture of resistance genes in chicken meat, it is possible to increase the number of tested samples, optimize the PCR method or possibly expand methods for the study of antibiotic resistome.

Klíčová slova

kuřecí maso, antibiotický rezistom, polymerázová řetězová reakce

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Magda Janalíková, Ph.D.

Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně

Fakulta technologická

Magisterský studijní program / obor:
Technologie potravin / -