Evoluce CRISPR-Cas systémů a jejich využití v editaci bakteriálních genomů

Bc. Jiří Holoubek

Bachelor's thesis

Evolution of CRISPR-Cas systems and their use in bacterial genome editing

Anotácia:

Systémy CRISPR-Cas získané imunitní odpovědi se vyskytují přibližně u poloviny bakterií a tří čtvrtin archaeí. Doposud byly popsány dvě třídy, 6 typů a několik subtypů těchto systémů. Tato shrnující práce popisuje mechanizmy působení CRISPR-Cas systémů, jejich klasifikaci a evoluční události, které stojí za existencí tak velké diverzity těchto obranných systémů. Součástí je popis možného využití CRISPR-Cas systémů v genovém inženýrství při editacích bakteriálních a fágových genomů. A možné praktické využití těchto metod v průmyslové či biomedicínské praxi.

Abstract:

The CRISPR-Cas systems of adaptive immunity are widespread amongst half of the bacteria and three quarters of the archaea. Two classes, six types and several subtypes have been described. This review describes mechanisms of CRISPR-Cas systems, their classification and evolution events which stand behind the existence of such a wide diversity of these defense systems. It also includes a description of possible uses of CRISPR-Cas systems in genetic engineering for editing bacterial and bacteriophage genomes, and the subsequent possible use of these methods in industry or biomedicine.

Kľúčové slová

CRISPR-Cas, získaný imunitní systém, evoluce, klasifikace, editace bakteriálních genomů, bakteriofág, adaptive immune system, evolution, classification, bacterial genome editing, bacteriophage

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 6. 2018
• Vedúci: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Juraj Bosák, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology