Methods and workflows for analysis of high-throughput sequencing data – Mgr. Jan Oppelt, Ph.D.
Mgr. Jan Oppelt, Ph.D.
Doctoral thesis
Methods and workflows for analysis of high-throughput sequencing data
Methods and workflows for analysis of high-throughput sequencing data
Abstract:
Výrazné snížení nákladů vysoce výkonného sekvencování v posledních několika letech, zpřístupnilo tyto metody široké škále vědců. Chceme-li získat informace skryté v sekvenačních datech, musíme je zpracovat pomocí bioinformatických metod - workflow. Workflow se skládají z mnoha samostatných kroků, počínaje designem experimentu, přes počáteční kontrolou hrubých dat a mnohé kroky kontroly kvality až po …moreAbstract:
The significant decrease in the cost of high-throughput sequencing during the past few years has made it available for a wider scope of researchers. To extract information hidden in sequencing data, we need to process it using bioinformatics methods - workflows. Workflows consist of many separate steps starting with experimental design, through the initial check of raw data, and various quality control …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 17. 7. 2018
Identifier:
https://is.muni.cz/th/lpcnt/
Thesis defence
- Date of defence: 10. 10. 2018
- Supervisor: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Reader: Mgr. Josef Pasulka, Ph.D., Dr. Attila Gyenesei
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Biochemistry (4-years) / Biomolecular Chemistry
Theses on a related topic
-
Vyhodnocení dat z vysoce výkonného sekvenování
Jan Oppelt -
Exprese genů zapojených do obrany rostlin proti patogenům u Brachypodium distachyon Zadané téma anglicky Expression of genes involved in plant defense against pathogens in Brachypodium distachyon
Andrea RADKOVÁ -
Genová exprese u aloploidů a mezidruhových kříženců rostlin
Marek Glombik -
Metal-induced gene expression changes
Lucie Válková -
Nové mechanismy regulace exprese vybraných biotransformačních enzymů u hepatocelulárního karcinomu
Kateřina Nevědělová -
Moderní metody analýzy genomu a jejich využití v mikrobiologii
Bezdíček Bezdíček -
Metody editace genomu bakterií a jejich aplikace
Marie Daňková -
Molekulární metody editace genomu
Martin Dudáš