Mapování genotypů původce syfilis v celosvětovém měřítku – Bc. Luboš Pajtina
Bc. Luboš Pajtina
Bachelor's thesis
Mapování genotypů původce syfilis v celosvětovém měřítku
Worldwide genotype mapping of the agent of syphilis
Abstract:
Bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum, způsobuje onemocnění syfilis. V práci jsou popsány dva hlavní způsoby molekulární typizace bakterie T. pallidum: CDC metoda a sekvenační metoda. Podle metody CDC byl jako dominantní typ bakterie určen ve většině zkoumaných oblastí typ 14d/f obsahující 14 kopií 60-pb dlouhé repetitivní sekvence v genu arp, restrikční profil d získaný z genů tprE, tprG, tprJ …moreAbstract:
Bacteria Treponema pallidum subspecies pallidum is the causative agent of syphilis. This work describes the two main approaches for molecular typing of T. pallidum: the CDC typing and the sequencing-based typing system. Using the CDC typing, genotype 14d/f was detected as the most abundant type containing 14 repeats of the 60-bp long sequence in the arp gene, restriction profile d acquired from tprE …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 7. 1. 2015
Identifier:
https://is.muni.cz/th/q55dw/
Thesis defence
- Date of defence: 9. 2. 2015
- Supervisor: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics
Theses on a related topic
-
Sekvenční analýza genomů Treponema pallidum subsp. pallidum izolovaných z klinického materiálu
Linda Grillová -
Komparativní genomika Treponema pallidum: cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice
Petra Pospíšilová -
Sekvenční analýza genomů Treponema pallidum subsp. pallidum izolovaných z klinického materiálu
Linda Grillová -
Comparative genomics of Treponema pallidum subspecies and molecular diagnostics of syphilis in the Czech Republic
Lenka Mikalová -
Treponema pallidum in clinical isolates: from diagnostics to whole genome sequencing
Eliška Vrbová -
Mapování kandidátních lokusů pro typování a fylogenetickou analýzu v genomu Treponema pallidum
Lukáš Nechvátal -
Restrikční mapování genomů a genomová amplifikace patogenních kmenů rodu Treponema
Michal Strouhal -
Komparativní genomika Treponema pallidum: cesta od určení sekvence chromozomu k aplikacím v klinické diagnostice
Petra Pospíšilová