Aplikace sekvenování nové generace pro fylogenetickou analýzu bakteriálních genomů a metagenomiku – Mgr. Vojtěch Kovařovic
Mgr. Vojtěch Kovařovic
Bachelor's thesis
Aplikace sekvenování nové generace pro fylogenetickou analýzu bakteriálních genomů a metagenomiku
Applications of next-generation sequencing for phylogenetic analysis of microbial genomes and metagenomics
Abstract:
Tato práce popisuje využití sekvenování nové generace pro klasifikaci bakteriálních druhů, diagnostiku klinicky významných kmenů a metagenomiku. V práci je nejprve představena historie sekvenování DNA a principy současných sekvenátorů nové generace, přičemž se práce podrobněji zaměřuje na polovodičové sekvenování. Dále jsou popsány bioinformatické nástroje pro komplementaci sekvence, detekci jednonukelotidových …moreAbstract:
The thesis describes the use of next-generation sequencing for the classification of microbial species, diagnostics clinicaly important strains and metagenomics. At the beginning, the thesis presents the history of the DNA sequencing and principles of contemporary next-generation sequencers, especially of the semiconductor sequencing. The next part describes bioinformatics instruments used for sequence …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2015
Identifier:
https://is.muni.cz/th/kztvs/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 6. 2015
- Supervisor: doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
KOVAŘOVIC, Vojtěch. \textit{Aplikace sekvenování nové generace pro fylogenetickou analýzu bakteriálních genomů a metagenomiku}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2015. Available from: https://theses.cz/id/ivoqox/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics
Theses on a related topic
-
Analýza panelu genů modifikujících průběh onemocnění cystické fibrózy pomocí technologie Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS)
Jan Tuček -
Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS) v molekulární diagnostice arytmogenních onemocnění
Iva Synková -
Bioinformatics methods to connect the methylation data from profiling microarrays and next-generation sequencing
Siarhei Paliavoi -
Nová generace sekvenování (Next Generation Sequencing), využití v klinické diagnostice
Michaela Jaborníková -
Multiplexní amplifikace specifických cílových sekvencí a jejich následné resekvenování za využití platformy sekvenování nové generace (next-generation sequencing, NGS), aplikace v molekulárně genetické diagnostice cystické fibrózy
Marie Kývalová -
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová -
Sekvenování nové generace při studiu regulace genů u rostlin
David Vlk -
Sekvenování nové generace jako nástroj identifikace nových rostlinných virů
Hana NOVOTNÁ