Strukturní analýza přirozeně se vyskytujících sekvencí interagujících s nádorovým supresorem p53.

Lucie PODEŠVOVÁ

Bakalářská práce

Structural analysis of naturally occuring DNA sequences interacting with tumor suppressor p53.

Anotace:

Protein p53 spadá do velmi studované oblasti molekulární biologie díky své schopnosti regulovat expresi mnoha genů a tak ovlivňovat řadu buněčných procesů. Protein p53 je často označován za strážce genomu, a to proto, že svou regulační aktivitou může navozovat apoptózu v případech, kdy buňky již nemohou žádnými mechanismy opravit poškozenou DNA, čímž může p53 v důsledku zabránit vzniku nádorového bujení. V této práci byla zkoumána sekvence, k níž by mohl protein p53 vykazovat sekvenčně nespecifickou vazbu. K analýze této sekvence byla použita enzymatická sonda - nukleáza S1 a dále restrikční endonukleázy. V neposlední řadě byla odzkoušena samotná vazba wt p53 na zkoumanou sekvenci DNA.

Abstract:

Protein p53 falls into a very studied area of molecular biology due to its ability to regulate expression of many genes and influence a number of cellular processes. Because of its regulatory activity to induce apoptose in cases where cells are not able to repair DNA damage by any mechanisms, p53 is often labelled as a guardian of genome. This thesis deals with the sequence of DNA that could be in some conditions responsible for non sequence specific binding of p53. For analysis of this sequence, enzymatic probe - nuclease S1 and restrict endonucleases were used. Finally, the binding of wt p53 was tested for the examined sequence.

Klíčová slova

Protein p53, sekvenčně specifická vazba, sekvenčně nespecifická vazba, lokální otevřené struktury, enzymatické sondy

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 4. 2013

Zveřejnit od: 22. 4. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 5. 2013
• Vedoucí: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA V OSTRAVĚ

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie