Molekulární charakterizace plazmidů koaguláza negativních stafylokoků

Bc. et Bc. Lenka Fišarová

Master's thesis

Molecular characterization of plasmids in coagulase-negative staphylococci

Abstract:

Koaguláza-negativní stafylokoky jsou známé především jako komenzálové na těle člověka a zvířat, mohou však způsobovat onemocnění, především u oslabených jedinců a pacietů s umělými tělními náhradami. Často bývají rezistentní k antibiotikům a geny rezistence mohou být umístěny na mobilních genetických elementech, jako jsou plazmidy. Rezistence se tak může šířit na jiné druhy bakterií. Cílem práce bylo odhalit rezistenci k antibiotikům u vybraných kmenů koaguláza-negativních stafylokoků, analyzovat jejich plazmidy, srovnat je mezi sebou a detekovat na nich geny způsobující tuto rezistenci. Většina kmenů byla rezistentní alespoň na jedno antibiotikum, mnohé kmeny byly rezistentní k většímu počtu antibiotik. Většina analyzovaných kmenů obsahovala také větší počet plazmidů. V případě rezistence k tetracyklinu a erytromycinu bylo detekováno několik genů rezistence. Pomocí restrikčního štěpení byly odhaleny plazmidy shodné u kmenů S. aureus, S. haemolyticus a S. petrasii, což svědčí o jejich horizontálním přenosu.

Abstract:

Coagulase-negative staphylococci are mostly known as comensals on the body of both humans and animals. However, they can cause disease, especially in weakened individuals and patients with various medical devices. They are often resistant to antimicrobials and the resistance genes can be carried on mobile genetic elements such as plasmids. Therefore, resistance can be spread onto different bacterial species. The goal of this thesis was to reveal resistance in several strains of coaguase-negative staphylococci, to analyze their plasmids, compare them and detect their resistance genes. Most strains were resistant to at least one antibiotic, many of them to more antibiotics. Most of the analyzed strains also contained a higher number of plasmids. In case of tetracycline and erythromycin resistance, several resistance genes were detected. Restriction cleavage revealed similarity of plasmids in S. aureus, S. haemolyticus and S. petrasii strains, which suggests horizontal transfer of the plasmids.

Keywords

koaguláza-negativní stafylokoky, plazmidy, rezistence k antibiotikům, restrikční analýza, geny rezistence, shoda plazmidů, horizontální přenos, coagulase-negative staphylococci, plasmids, antimicrobial resistance, restriction analysis, resistance genes, plasmid match, horizontal transfer

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 11. 5. 2015

Thesis defence

• Date of defence: 5. 6. 2015
• Supervisor: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Special Biology